67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2202 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0564  protein of unknown function DUF1111  67.29 
 
 		 510 aa  661    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2202  hypothetical protein  100 
 
 		 501 aa  1018    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.719415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1369  hypothetical protein  64.14 
 
 		 517 aa  629  1e-179  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.646546 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3025  hypothetical protein  62.6 
 
 		 502 aa  617  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0498706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1545  thiol oxidoreductase with 2 cytochrome c heme-binding sites  61.84 
 
 		 502 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0196  hypothetical protein  62.04 
 
 		 502 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943997  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0642  hypothetical protein  58.24 
 
 		 503 aa  531  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798381  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4314  protein of unknown function DUF1111  54.99 
 
 		 512 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3528  hypothetical protein  53.59 
 
 		 517 aa  484  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.561681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0978  hypothetical protein  52.31 
 
 		 475 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4476  hypothetical protein  51.65 
 
 		 475 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4577  protein of unknown function DUF1111  54.35 
 
 		 512 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0615808 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0910  hypothetical protein  50.55 
 
 		 475 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0949  hypothetical protein  50.55 
 
 		 475 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0334  hypothetical protein  51.5 
 
 		 528 aa  454  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1785  hypothetical protein  49.1 
 
 		 462 aa  448  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4367  lipoprotein, putative  51.21 
 
 		 475 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3296  hypothetical protein  53.63 
 
 		 470 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0884  hypothetical protein  51.01 
 
 		 461 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.858351  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4940  hypothetical protein  52.43 
 
 		 473 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4063  hypothetical protein  50.77 
 
 		 475 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56840  hypothetical protein  51.56 
 
 		 473 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4489  hypothetical protein  49.89 
 
 		 475 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02714  hypothetical protein  48.78 
 
 		 443 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003124  predicted thiol oxidoreductase  48.23 
 
 		 460 aa  431  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37850  hypothetical protein  52.74 
 
 		 471 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0692567  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2834  hypothetical protein  49.77 
 
 		 469 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2144  hypothetical protein  43.96 
 
 		 541 aa  368  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801721 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52140  thiol oxidoreductase  46.42 
 
 		 452 aa  364  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1924  hypothetical protein  44.75 
 
 		 492 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360714 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1459  hypothetical protein  43.78 
 
 		 479 aa  362  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0639282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1526  hypothetical protein  44.68 
 
 		 503 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2558  hypothetical protein  42.23 
 
 		 459 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0187724  hitchhiker  0.000000017904 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1803  hypothetical protein  43.99 
 
 		 562 aa  354  2e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2085  hypothetical protein  43.08 
 
 		 560 aa  351  2e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.792023  normal  0.948616 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2562  hypothetical protein  42.45 
 
 		 475 aa  350  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000435033 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1991  hypothetical protein  43.68 
 
 		 450 aa  347  4e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0687  thiol oxidoreductase containing 2 cytochrome c heme-binding sites  40.93 
 
 		 491 aa  337  2.9999999999999997e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3869  protein of unknown function DUF1111  44.72 
 
 		 471 aa  331  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.421634  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0667  thiol oxidoreductase  42.56 
 
 		 480 aa  325  1e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27219  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2722  protein of unknown function DUF1111  44.6 
 
 		 427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.103047  normal  0.741688 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1461  thiol oxidoreductase-like  41.91 
 
 		 418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0454641  normal  0.0102137 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2969  hypothetical protein  40.37 
 
 		 456 aa  301  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.594784 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0792  hypothetical protein  40.33 
 
 		 549 aa  299  9e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0672  hypothetical protein  39.68 
 
 		 551 aa  295  9e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.230866  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0723  hypothetical protein  39.41 
 
 		 548 aa  290  4e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324496  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0677  hypothetical protein  38.66 
 
 		 543 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3791  hypothetical protein  39.1 
 
 		 539 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0938  hypothetical protein  38.1 
 
 		 541 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00230674  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0695  putative lipoprotein  38.83 
 
 		 538 aa  281  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0812  hypothetical protein  39.23 
 
 		 542 aa  281  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0972  hypothetical protein  37.91 
 
 		 541 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  36.85 
 
 		 879 aa  264  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  40.1 
 
 		 1028 aa  260  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1574  protein of unknown function DUF1111  38.58 
 
 		 970 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  36.6 
 
 		 1707 aa  253  6e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3195  hypothetical protein  40.43 
 
 		 421 aa  246  6e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.889412 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1997  protein of unknown function DUF1111  34.53 
 
 		 737 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107987  normal  0.248873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2090  protein of unknown function DUF1111  35.53 
 
 		 794 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1933  protein of unknown function DUF1111  28.98 
 
 		 472 aa  145  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.242314  normal  0.0976167 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0795  thiol oxidoreductase-like  31.15 
 
 		 511 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6445  thiol oxidoreductase-like protein  27.98 
 
 		 564 aa  67.8  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3543  thiol oxidoreductase-like  24.5 
 
 		 519 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00122263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13401  hypothetical protein  58.54 
 
 		 41 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.28 
 
 		 652 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2947  cytochrome-c peroxidase  27.91 
 
 		 317 aa  44.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0431502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13411  hypothetical protein  31.52 
 
 		 106 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>