66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4314 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4314  protein of unknown function DUF1111  100 
 
 
512 aa  1048    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3528  hypothetical protein  65.5 
 
 
517 aa  671    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.561681  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4577  protein of unknown function DUF1111  90.04 
 
 
512 aa  931    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0615808 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0334  hypothetical protein  62.17 
 
 
528 aa  597  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0642  hypothetical protein  57.41 
 
 
503 aa  545  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798381  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0564  protein of unknown function DUF1111  58.99 
 
 
510 aa  528  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3025  hypothetical protein  55.27 
 
 
502 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0498706  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0196  hypothetical protein  54.51 
 
 
502 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943997  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1545  thiol oxidoreductase with 2 cytochrome c heme-binding sites  56.16 
 
 
502 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1369  hypothetical protein  54.38 
 
 
517 aa  498  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.646546 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2202  hypothetical protein  54.99 
 
 
501 aa  496  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.719415  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4476  hypothetical protein  50.98 
 
 
475 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.236218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0978  hypothetical protein  50.98 
 
 
475 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170128 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0884  hypothetical protein  49.33 
 
 
461 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.858351  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0949  hypothetical protein  50.77 
 
 
475 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0910  hypothetical protein  50.77 
 
 
475 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4940  hypothetical protein  50.55 
 
 
473 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56840  hypothetical protein  50.99 
 
 
473 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4367  lipoprotein, putative  49.02 
 
 
475 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4063  hypothetical protein  49.24 
 
 
475 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1785  hypothetical protein  47.76 
 
 
462 aa  420  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003124  predicted thiol oxidoreductase  48.21 
 
 
460 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02714  hypothetical protein  48.66 
 
 
443 aa  418  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4489  hypothetical protein  48.8 
 
 
475 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3296  hypothetical protein  49.06 
 
 
470 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37850  hypothetical protein  50.87 
 
 
471 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0692567  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2834  hypothetical protein  46.89 
 
 
469 aa  385  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2144  hypothetical protein  42.86 
 
 
541 aa  371  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0801721 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2562  hypothetical protein  43.96 
 
 
475 aa  364  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000435033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1924  hypothetical protein  44.37 
 
 
492 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360714 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1459  hypothetical protein  44.05 
 
 
479 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0639282  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1526  hypothetical protein  45 
 
 
503 aa  353  5e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3869  protein of unknown function DUF1111  45.9 
 
 
471 aa  352  7e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.421634  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2085  hypothetical protein  42.8 
 
 
560 aa  352  7e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.792023  normal  0.948616 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1803  hypothetical protein  41.29 
 
 
562 aa  346  7e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2558  hypothetical protein  42.39 
 
 
459 aa  341  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0187724  hitchhiker  0.000000017904 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0687  thiol oxidoreductase containing 2 cytochrome c heme-binding sites  41.08 
 
 
491 aa  333  3e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0667  thiol oxidoreductase  42.92 
 
 
480 aa  326  6e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27219  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52140  thiol oxidoreductase  42.19 
 
 
452 aa  323  5e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2969  hypothetical protein  42.76 
 
 
456 aa  317  4e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.594784 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2722  protein of unknown function DUF1111  42.92 
 
 
427 aa  309  8e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.103047  normal  0.741688 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1991  hypothetical protein  40.68 
 
 
450 aa  307  3e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1461  thiol oxidoreductase-like  39.91 
 
 
418 aa  297  3e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0454641  normal  0.0102137 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0938  hypothetical protein  38.91 
 
 
541 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00230674  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0677  hypothetical protein  36.77 
 
 
543 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  39.27 
 
 
879 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0723  hypothetical protein  38.49 
 
 
548 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324496  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0792  hypothetical protein  37.45 
 
 
549 aa  280  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0972  hypothetical protein  37.87 
 
 
541 aa  280  5e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216526  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0672  hypothetical protein  37.22 
 
 
551 aa  276  9e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.230866  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3791  hypothetical protein  36.4 
 
 
539 aa  272  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0812  hypothetical protein  38.11 
 
 
542 aa  270  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  36.76 
 
 
1028 aa  258  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3195  hypothetical protein  39.67 
 
 
421 aa  257  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.889412 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0695  putative lipoprotein  35.37 
 
 
538 aa  254  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1574  protein of unknown function DUF1111  37.72 
 
 
970 aa  252  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  36.3 
 
 
1707 aa  250  5e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1997  protein of unknown function DUF1111  35.5 
 
 
737 aa  193  8e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107987  normal  0.248873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2090  protein of unknown function DUF1111  31.64 
 
 
794 aa  160  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126937  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1933  protein of unknown function DUF1111  28.4 
 
 
472 aa  160  7e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.242314  normal  0.0976167 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0795  thiol oxidoreductase-like  28.71 
 
 
511 aa  100  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3543  thiol oxidoreductase-like  27.18 
 
 
519 aa  70.9  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00122263  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6445  thiol oxidoreductase-like protein  26.24 
 
 
564 aa  60.8  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13411  hypothetical protein  38.55 
 
 
106 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13401  hypothetical protein  56.1 
 
 
41 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1291  putative surface layer protein, with cytochrome c domain  27.48 
 
 
620 aa  43.9  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.304881  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>