64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_56840 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4940  hypothetical protein  94.29 
 
 		 473 aa  888    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56840  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  961    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3296  hypothetical protein  73.06 
 
 		 470 aa  666    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0949  hypothetical protein  72.97 
 
 		 475 aa  671    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0978  hypothetical protein  72.53 
 
 		 475 aa  669    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4489  hypothetical protein  72.78 
 
 		 475 aa  699    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4476  hypothetical protein  72.31 
 
 		 475 aa  671    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4063  hypothetical protein  73.66 
 
 		 475 aa  697    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4367  lipoprotein, putative  72.81 
 
 		 475 aa  693    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0910  hypothetical protein  72.75 
 
 		 475 aa  669    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37850  hypothetical protein  68.47 
 
 		 471 aa  588  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0692567  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003124  predicted thiol oxidoreductase  62.7 
 
 		 460 aa  579  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02714  hypothetical protein  63.16 
 
 		 443 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0884  hypothetical protein  63.64 
 
 		 461 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.858351  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1785  hypothetical protein  60.41 
 
 		 462 aa  551  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2834  hypothetical protein  56.82 
 
 		 469 aa  500  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3025  hypothetical protein  55.63 
 
 		 502 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0498706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1545  thiol oxidoreductase with 2 cytochrome c heme-binding sites  55.21 
 
 		 502 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0642  hypothetical protein  55.09 
 
 		 503 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0196  hypothetical protein  55.21 
 
 		 502 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943997  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0564  protein of unknown function DUF1111  54.57 
 
 		 510 aa  463  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2562  hypothetical protein  51.32 
 
 		 475 aa  449  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000435033 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1369  hypothetical protein  53.11 
 
 		 517 aa  448  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.646546 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1459  hypothetical protein  51.2 
 
 		 479 aa  443  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0639282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1924  hypothetical protein  51.76 
 
 		 492 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360714 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2202  hypothetical protein  51.56 
 
 		 501 aa  441  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.719415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4314  protein of unknown function DUF1111  50.99 
 
 		 512 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3869  protein of unknown function DUF1111  52.83 
 
 		 471 aa  426  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.421634  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3528  hypothetical protein  51.54 
 
 		 517 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.561681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1526  hypothetical protein  50.43 
 
 		 503 aa  424  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4577  protein of unknown function DUF1111  51.65 
 
 		 512 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0615808 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2144  hypothetical protein  47.55 
 
 		 541 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801721 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0667  thiol oxidoreductase  49 
 
 		 480 aa  409  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27219  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2085  hypothetical protein  47.53 
 
 		 560 aa  403  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.792023  normal  0.948616 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0687  thiol oxidoreductase containing 2 cytochrome c heme-binding sites  45.34 
 
 		 491 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1803  hypothetical protein  47.1 
 
 		 562 aa  397  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1991  hypothetical protein  47.79 
 
 		 450 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52140  thiol oxidoreductase  48.5 
 
 		 452 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0334  hypothetical protein  45.93 
 
 		 528 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1461  thiol oxidoreductase-like  44.5 
 
 		 418 aa  353  2e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0454641  normal  0.0102137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2558  hypothetical protein  42.99 
 
 		 459 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0187724  hitchhiker  0.000000017904 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2969  hypothetical protein  46.39 
 
 		 456 aa  352  8e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.594784 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2722  protein of unknown function DUF1111  45.71 
 
 		 427 aa  322  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.103047  normal  0.741688 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0938  hypothetical protein  39.76 
 
 		 541 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00230674  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0972  hypothetical protein  39.15 
 
 		 541 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0723  hypothetical protein  37.71 
 
 		 548 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324496  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0672  hypothetical protein  37.78 
 
 		 551 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.230866  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0677  hypothetical protein  39.35 
 
 		 543 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0792  hypothetical protein  36.48 
 
 		 549 aa  301  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0695  putative lipoprotein  38.91 
 
 		 538 aa  298  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0812  hypothetical protein  38.62 
 
 		 542 aa  296  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3791  hypothetical protein  36.18 
 
 		 539 aa  291  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  40.86 
 
 		 879 aa  279  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1574  protein of unknown function DUF1111  40.49 
 
 		 970 aa  276  8e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  41.82 
 
 		 1028 aa  271  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  37.42 
 
 		 1707 aa  259  6e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3195  hypothetical protein  37.65 
 
 		 421 aa  247  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.889412 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1997  protein of unknown function DUF1111  36.65 
 
 		 737 aa  215  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107987  normal  0.248873 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1933  protein of unknown function DUF1111  30.13 
 
 		 472 aa  173  5e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.242314  normal  0.0976167 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2090  protein of unknown function DUF1111  30.23 
 
 		 794 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0795  thiol oxidoreductase-like  29.86 
 
 		 511 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6445  thiol oxidoreductase-like protein  26.39 
 
 		 564 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3543  thiol oxidoreductase-like  24.88 
 
 		 519 aa  53.1  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00122263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13401  hypothetical protein  58.54 
 
 		 41 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>