86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1997 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1997  protein of unknown function DUF1111  100 
 
 		 737 aa  1434    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107987  normal  0.248873 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003124  predicted thiol oxidoreductase  34.81 
 
 		 460 aa  240  6.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0884  hypothetical protein  35.89 
 
 		 461 aa  236  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.858351  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4476  hypothetical protein  38.17 
 
 		 475 aa  233  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236218 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0949  hypothetical protein  38.34 
 
 		 475 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0910  hypothetical protein  38.31 
 
 		 475 aa  230  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4940  hypothetical protein  37.06 
 
 		 473 aa  230  9e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02714  hypothetical protein  34.76 
 
 		 443 aa  229  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4367  lipoprotein, putative  35.87 
 
 		 475 aa  229  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1785  hypothetical protein  33.64 
 
 		 462 aa  228  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56840  hypothetical protein  36.65 
 
 		 473 aa  227  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0196  hypothetical protein  38.76 
 
 		 502 aa  224  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943997  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4063  hypothetical protein  36.3 
 
 		 475 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1545  thiol oxidoreductase with 2 cytochrome c heme-binding sites  38.42 
 
 		 502 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3025  hypothetical protein  38.9 
 
 		 502 aa  220  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0498706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3528  hypothetical protein  37.23 
 
 		 517 aa  220  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.561681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1526  hypothetical protein  36.72 
 
 		 503 aa  219  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0642  hypothetical protein  36.75 
 
 		 503 aa  216  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798381  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0978  hypothetical protein  36.54 
 
 		 475 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170128 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52140  thiol oxidoreductase  36.76 
 
 		 452 aa  212  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1369  hypothetical protein  37.17 
 
 		 517 aa  210  7e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.646546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4489  hypothetical protein  34.07 
 
 		 475 aa  210  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0667  thiol oxidoreductase  35.76 
 
 		 480 aa  209  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27219  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4314  protein of unknown function DUF1111  35.5 
 
 		 512 aa  207  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0564  protein of unknown function DUF1111  35.32 
 
 		 510 aa  204  6e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2834  hypothetical protein  37.44 
 
 		 469 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1991  hypothetical protein  35.31 
 
 		 450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0334  hypothetical protein  35.46 
 
 		 528 aa  197  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  33.62 
 
 		 1707 aa  196  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1461  thiol oxidoreductase-like  37.82 
 
 		 418 aa  196  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0454641  normal  0.0102137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4577  protein of unknown function DUF1111  36.57 
 
 		 512 aa  196  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0615808 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2562  hypothetical protein  34.34 
 
 		 475 aa  196  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000435033 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1459  hypothetical protein  35.45 
 
 		 479 aa  195  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0639282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3296  hypothetical protein  36.04 
 
 		 470 aa  192  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37850  hypothetical protein  38.32 
 
 		 471 aa  192  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0692567  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1574  protein of unknown function DUF1111  35.9 
 
 		 970 aa  189  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  34.64 
 
 		 1028 aa  189  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  34.11 
 
 		 879 aa  189  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3869  protein of unknown function DUF1111  36.39 
 
 		 471 aa  188  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.421634  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2722  protein of unknown function DUF1111  37.8 
 
 		 427 aa  184  6e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.103047  normal  0.741688 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1924  hypothetical protein  33.62 
 
 		 492 aa  180  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360714 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0687  thiol oxidoreductase containing 2 cytochrome c heme-binding sites  32.34 
 
 		 491 aa  179  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2558  hypothetical protein  29.88 
 
 		 459 aa  177  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0187724  hitchhiker  0.000000017904 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2969  hypothetical protein  34.56 
 
 		 456 aa  177  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.594784 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2144  hypothetical protein  30.69 
 
 		 541 aa  176  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801721 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2085  hypothetical protein  31.81 
 
 		 560 aa  172  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.792023  normal  0.948616 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1803  hypothetical protein  31.95 
 
 		 562 aa  171  6e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2202  hypothetical protein  32.85 
 
 		 501 aa  161  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.719415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0938  hypothetical protein  47.8 
 
 		 541 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00230674  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0972  hypothetical protein  47.8 
 
 		 541 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0677  hypothetical protein  46.2 
 
 		 543 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0723  hypothetical protein  46.84 
 
 		 548 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324496  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0792  hypothetical protein  44.65 
 
 		 549 aa  132  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3791  hypothetical protein  44.65 
 
 		 539 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0812  hypothetical protein  42.77 
 
 		 542 aa  129  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2090  protein of unknown function DUF1111  29.72 
 
 		 794 aa  128  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126937  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0695  putative lipoprotein  45.28 
 
 		 538 aa  127  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0672  hypothetical protein  44.03 
 
 		 551 aa  126  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.230866  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1933  protein of unknown function DUF1111  28.57 
 
 		 472 aa  121  3.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.242314  normal  0.0976167 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3195  hypothetical protein  37.11 
 
 		 421 aa  102  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.889412 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0795  thiol oxidoreductase-like  38.35 
 
 		 511 aa  82.4  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3543  thiol oxidoreductase-like  39.56 
 
 		 519 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00122263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  27.15 
 
 		 558 aa  57.8  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  33.33 
 
 		 593 aa  51.6  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  39 
 
 		 1919 aa  51.6  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  37.7 
 
 		 743 aa  51.2  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  39.19 
 
 		 714 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6445  thiol oxidoreductase-like protein  33.01 
 
 		 564 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.85 
 
 		 837 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.89 
 
 		 417 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  40 
 
 		 2082 aa  48.1  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2561  regulator of chromosome condensation RCC1  35.14 
 
 		 106 aa  48.1  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.111508  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  26.26 
 
 		 1129 aa  47.8  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  34.81 
 
 		 717 aa  47.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  35.24 
 
 		 911 aa  47.8  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.96 
 
 		 818 aa  47  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  36.84 
 
 		 810 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.36 
 
 		 821 aa  46.2  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  33.61 
 
 		 363 aa  45.8  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  33.61 
 
 		 363 aa  45.8  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  34.65 
 
 		 328 aa  45.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  32.5 
 
 		 1222 aa  45.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.61 
 
 		 1679 aa  45.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  28.95 
 
 		 461 aa  44.7  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  36.11 
 
 		 807 aa  44.7  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  37.08 
 
 		 681 aa  44.3  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.378302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>