65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4367 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0910  hypothetical protein  77.19 
 
 		 475 aa  738    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4367  lipoprotein, putative  100 
 
 		 475 aa  977    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4063  hypothetical protein  94.74 
 
 		 475 aa  934    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4489  hypothetical protein  79.32 
 
 		 475 aa  763    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4476  hypothetical protein  76.75 
 
 		 475 aa  738    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0978  hypothetical protein  78.51 
 
 		 475 aa  747    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4940  hypothetical protein  73.52 
 
 		 473 aa  688    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0949  hypothetical protein  77.41 
 
 		 475 aa  739    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3296  hypothetical protein  72.63 
 
 		 470 aa  682    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56840  hypothetical protein  73.25 
 
 		 473 aa  686    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37850  hypothetical protein  69.58 
 
 		 471 aa  612  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0692567  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0884  hypothetical protein  62.16 
 
 		 461 aa  560  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.858351  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003124  predicted thiol oxidoreductase  60 
 
 		 460 aa  551  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02714  hypothetical protein  60.32 
 
 		 443 aa  548  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1785  hypothetical protein  59.18 
 
 		 462 aa  539  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0564  protein of unknown function DUF1111  55.16 
 
 		 510 aa  488  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3025  hypothetical protein  54.82 
 
 		 502 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0498706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1545  thiol oxidoreductase with 2 cytochrome c heme-binding sites  53.59 
 
 		 502 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0196  hypothetical protein  53.85 
 
 		 502 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943997  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0642  hypothetical protein  53.95 
 
 		 503 aa  473  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798381  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2834  hypothetical protein  53.74 
 
 		 469 aa  473  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2202  hypothetical protein  51.21 
 
 		 501 aa  449  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.719415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1369  hypothetical protein  52.56 
 
 		 517 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.646546 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3528  hypothetical protein  49.89 
 
 		 517 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.561681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4314  protein of unknown function DUF1111  49.02 
 
 		 512 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2562  hypothetical protein  48.57 
 
 		 475 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000435033 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2144  hypothetical protein  46.7 
 
 		 541 aa  423  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1526  hypothetical protein  47.83 
 
 		 503 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2085  hypothetical protein  44.22 
 
 		 560 aa  409  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.792023  normal  0.948616 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1459  hypothetical protein  48.65 
 
 		 479 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0639282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3869  protein of unknown function DUF1111  50.23 
 
 		 471 aa  409  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.421634  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4577  protein of unknown function DUF1111  49.02 
 
 		 512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0615808 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1803  hypothetical protein  47.02 
 
 		 562 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0687  thiol oxidoreductase containing 2 cytochrome c heme-binding sites  46.06 
 
 		 491 aa  403  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1924  hypothetical protein  48.79 
 
 		 492 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360714 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0667  thiol oxidoreductase  48.57 
 
 		 480 aa  392  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27219  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0334  hypothetical protein  46.61 
 
 		 528 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52140  thiol oxidoreductase  46.33 
 
 		 452 aa  365  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2558  hypothetical protein  43.18 
 
 		 459 aa  358  8e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0187724  hitchhiker  0.000000017904 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1991  hypothetical protein  44.19 
 
 		 450 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2969  hypothetical protein  44.29 
 
 		 456 aa  336  5.999999999999999e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.594784 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1461  thiol oxidoreductase-like  42.02 
 
 		 418 aa  332  7.000000000000001e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0454641  normal  0.0102137 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2722  protein of unknown function DUF1111  43.22 
 
 		 427 aa  309  8e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.103047  normal  0.741688 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0672  hypothetical protein  36.81 
 
 		 551 aa  295  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.230866  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0695  putative lipoprotein  37.47 
 
 		 538 aa  293  5e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0723  hypothetical protein  35.93 
 
 		 548 aa  291  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324496  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0677  hypothetical protein  37.25 
 
 		 543 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0938  hypothetical protein  36.47 
 
 		 541 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00230674  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0972  hypothetical protein  36.27 
 
 		 541 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  41.71 
 
 		 879 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  43.96 
 
 		 1028 aa  279  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1574  protein of unknown function DUF1111  40.13 
 
 		 970 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0812  hypothetical protein  35.83 
 
 		 542 aa  271  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0792  hypothetical protein  34.44 
 
 		 549 aa  266  4e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3791  hypothetical protein  33.64 
 
 		 539 aa  251  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  36.7 
 
 		 1707 aa  247  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3195  hypothetical protein  38.12 
 
 		 421 aa  243  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.889412 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1997  protein of unknown function DUF1111  35.87 
 
 		 737 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107987  normal  0.248873 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1933  protein of unknown function DUF1111  30.08 
 
 		 472 aa  168  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.242314  normal  0.0976167 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2090  protein of unknown function DUF1111  30.61 
 
 		 794 aa  160  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0795  thiol oxidoreductase-like  28.64 
 
 		 511 aa  117  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3543  thiol oxidoreductase-like  27.46 
 
 		 519 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00122263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6445  thiol oxidoreductase-like protein  24.64 
 
 		 564 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13411  hypothetical protein  36.14 
 
 		 106 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13401  hypothetical protein  51.22 
 
 		 41 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>