72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0792 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0695  putative lipoprotein  64.5 
 
 		 538 aa  669    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0672  hypothetical protein  83.05 
 
 		 551 aa  906    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.230866  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3791  hypothetical protein  86.42 
 
 		 539 aa  961    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0938  hypothetical protein  78.11 
 
 		 541 aa  860    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00230674  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0972  hypothetical protein  77.74 
 
 		 541 aa  857    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0677  hypothetical protein  80.73 
 
 		 543 aa  877    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0812  hypothetical protein  77.43 
 
 		 542 aa  856    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0792  hypothetical protein  100 
 
 		 549 aa  1128    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0723  hypothetical protein  75.37 
 
 		 548 aa  836    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324496  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2834  hypothetical protein  40.04 
 
 		 469 aa  317  5e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0884  hypothetical protein  38.55 
 
 		 461 aa  307  3e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.858351  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1785  hypothetical protein  37.99 
 
 		 462 aa  302  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3869  protein of unknown function DUF1111  40.3 
 
 		 471 aa  302  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.421634  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4940  hypothetical protein  37.21 
 
 		 473 aa  299  7e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2202  hypothetical protein  40.33 
 
 		 501 aa  299  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.719415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56840  hypothetical protein  37.5 
 
 		 473 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0667  thiol oxidoreductase  38.53 
 
 		 480 aa  294  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27219  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003124  predicted thiol oxidoreductase  37.22 
 
 		 460 aa  293  6e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0642  hypothetical protein  37.74 
 
 		 503 aa  292  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52140  thiol oxidoreductase  37.6 
 
 		 452 aa  289  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2562  hypothetical protein  37.2 
 
 		 475 aa  288  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000435033 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1369  hypothetical protein  38.55 
 
 		 517 aa  288  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.646546 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02714  hypothetical protein  37.22 
 
 		 443 aa  286  8e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0687  thiol oxidoreductase containing 2 cytochrome c heme-binding sites  39.69 
 
 		 491 aa  286  9e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1526  hypothetical protein  37.9 
 
 		 503 aa  283  6.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4314  protein of unknown function DUF1111  37.45 
 
 		 512 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0564  protein of unknown function DUF1111  38.98 
 
 		 510 aa  277  3e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1924  hypothetical protein  38.28 
 
 		 492 aa  276  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0949  hypothetical protein  35.76 
 
 		 475 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1545  thiol oxidoreductase with 2 cytochrome c heme-binding sites  36.75 
 
 		 502 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0910  hypothetical protein  35.56 
 
 		 475 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0196  hypothetical protein  36.95 
 
 		 502 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943997  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3025  hypothetical protein  36.62 
 
 		 502 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0498706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4063  hypothetical protein  35.53 
 
 		 475 aa  273  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2969  hypothetical protein  35.54 
 
 		 456 aa  273  7e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.594784 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1459  hypothetical protein  36.84 
 
 		 479 aa  272  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0639282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1461  thiol oxidoreductase-like  36.73 
 
 		 418 aa  272  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0454641  normal  0.0102137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4476  hypothetical protein  35.7 
 
 		 475 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4577  protein of unknown function DUF1111  38.21 
 
 		 512 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0615808 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0978  hypothetical protein  35.34 
 
 		 475 aa  270  7e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170128 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2085  hypothetical protein  36.88 
 
 		 560 aa  268  2e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.792023  normal  0.948616 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3296  hypothetical protein  37.76 
 
 		 470 aa  267  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4367  lipoprotein, putative  34.44 
 
 		 475 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3528  hypothetical protein  36.51 
 
 		 517 aa  264  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.561681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2144  hypothetical protein  34.85 
 
 		 541 aa  262  1e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801721 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1803  hypothetical protein  35.07 
 
 		 562 aa  259  1e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2722  protein of unknown function DUF1111  37.89 
 
 		 427 aa  256  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.103047  normal  0.741688 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4489  hypothetical protein  33.64 
 
 		 475 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0334  hypothetical protein  35 
 
 		 528 aa  253  9.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37850  hypothetical protein  35 
 
 		 471 aa  247  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0692567  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1991  hypothetical protein  34.68 
 
 		 450 aa  247  4e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2558  hypothetical protein  32.64 
 
 		 459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0187724  hitchhiker  0.000000017904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  33.76 
 
 		 879 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1574  protein of unknown function DUF1111  45.26 
 
 		 970 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  33.05 
 
 		 1028 aa  209  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  38.61 
 
 		 1707 aa  194  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3195  hypothetical protein  31.55 
 
 		 421 aa  155  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.889412 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1933  protein of unknown function DUF1111  28.94 
 
 		 472 aa  151  4e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.242314  normal  0.0976167 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2090  protein of unknown function DUF1111  34.79 
 
 		 794 aa  141  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1997  protein of unknown function DUF1111  44.65 
 
 		 737 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107987  normal  0.248873 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0795  thiol oxidoreductase-like  27.48 
 
 		 511 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3543  thiol oxidoreductase-like  25.68 
 
 		 519 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00122263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6445  thiol oxidoreductase-like protein  26.6 
 
 		 564 aa  57.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13401  hypothetical protein  58.54 
 
 		 41 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.69 
 
 		 652 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  28.4 
 
 		 333 aa  48.9  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13411  hypothetical protein  34.52 
 
 		 106 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  32.03 
 
 		 328 aa  44.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5504  Di-heme cytochrome c peroxidase  31.21 
 
 		 297 aa  44.7  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  26.12 
 
 		 365 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  27.21 
 
 		 365 aa  44.3  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1052  hypothetical protein  28.96 
 
 		 827 aa  43.5  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.255534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>