63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1933 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1933  protein of unknown function DUF1111  100 
 
 
472 aa  984    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.242314  normal  0.0976167 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3869  protein of unknown function DUF1111  33.7 
 
 
471 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.421634  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1526  hypothetical protein  33.33 
 
 
503 aa  196  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1924  hypothetical protein  32.91 
 
 
492 aa  188  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360714 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52140  thiol oxidoreductase  32.97 
 
 
452 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1459  hypothetical protein  33.56 
 
 
479 aa  186  6e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0639282  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2722  protein of unknown function DUF1111  32.51 
 
 
427 aa  182  8.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.103047  normal  0.741688 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2969  hypothetical protein  31.91 
 
 
456 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.594784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3296  hypothetical protein  31.03 
 
 
470 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2834  hypothetical protein  30.71 
 
 
469 aa  180  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4476  hypothetical protein  30.8 
 
 
475 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.236218 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0949  hypothetical protein  30.93 
 
 
475 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0910  hypothetical protein  30.72 
 
 
475 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  29.84 
 
 
879 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56840  hypothetical protein  30.13 
 
 
473 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4063  hypothetical protein  30.51 
 
 
475 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4489  hypothetical protein  30.44 
 
 
475 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4940  hypothetical protein  29.61 
 
 
473 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  32.59 
 
 
1028 aa  171  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2562  hypothetical protein  31.83 
 
 
475 aa  171  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000435033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37850  hypothetical protein  29.51 
 
 
471 aa  169  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0692567  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4367  lipoprotein, putative  30.08 
 
 
475 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0978  hypothetical protein  30.08 
 
 
475 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170128 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0642  hypothetical protein  29.94 
 
 
503 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798381  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1991  hypothetical protein  30.98 
 
 
450 aa  164  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0334  hypothetical protein  31.08 
 
 
528 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3025  hypothetical protein  31.54 
 
 
502 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0498706  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1461  thiol oxidoreductase-like  29.31 
 
 
418 aa  162  8.000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0454641  normal  0.0102137 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0667  thiol oxidoreductase  28.63 
 
 
480 aa  162  9e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27219  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4314  protein of unknown function DUF1111  28.4 
 
 
512 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4577  protein of unknown function DUF1111  29.82 
 
 
512 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0615808 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0196  hypothetical protein  30.95 
 
 
502 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943997  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003124  predicted thiol oxidoreductase  29.44 
 
 
460 aa  156  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1369  hypothetical protein  29.74 
 
 
517 aa  155  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.646546 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1545  thiol oxidoreductase with 2 cytochrome c heme-binding sites  30.48 
 
 
502 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0672  hypothetical protein  29.02 
 
 
551 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.230866  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1785  hypothetical protein  29.38 
 
 
462 aa  153  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02714  hypothetical protein  30.23 
 
 
443 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0564  protein of unknown function DUF1111  30.88 
 
 
510 aa  152  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0884  hypothetical protein  28.97 
 
 
461 aa  151  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.858351  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0677  hypothetical protein  29.27 
 
 
543 aa  151  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0792  hypothetical protein  28.94 
 
 
549 aa  151  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0812  hypothetical protein  29.53 
 
 
542 aa  149  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3791  hypothetical protein  29.06 
 
 
539 aa  147  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0938  hypothetical protein  28.74 
 
 
541 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00230674  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2202  hypothetical protein  28.98 
 
 
501 aa  145  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.719415  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0972  hypothetical protein  28.74 
 
 
541 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216526  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0695  putative lipoprotein  28.19 
 
 
538 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1574  protein of unknown function DUF1111  34.66 
 
 
970 aa  143  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0687  thiol oxidoreductase containing 2 cytochrome c heme-binding sites  27.48 
 
 
491 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0723  hypothetical protein  28.35 
 
 
548 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324496  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3528  hypothetical protein  27.11 
 
 
517 aa  136  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.561681  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  27.92 
 
 
1707 aa  136  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2558  hypothetical protein  29.35 
 
 
459 aa  126  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0187724  hitchhiker  0.000000017904 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1803  hypothetical protein  26.32 
 
 
562 aa  125  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2144  hypothetical protein  27.29 
 
 
541 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0801721 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2085  hypothetical protein  26.08 
 
 
560 aa  120  7.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.792023  normal  0.948616 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3195  hypothetical protein  28.27 
 
 
421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.889412 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1997  protein of unknown function DUF1111  26.87 
 
 
737 aa  109  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107987  normal  0.248873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2090  protein of unknown function DUF1111  27.36 
 
 
794 aa  83.2  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126937  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0795  thiol oxidoreductase-like  24.04 
 
 
511 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3543  thiol oxidoreductase-like  28.24 
 
 
519 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00122263  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6445  thiol oxidoreductase-like protein  21.78 
 
 
564 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>