More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0475 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  100 
 
 		 1581 aa  3228    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.98 
 
 		 1564 aa  808    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.99 
 
 		 674 aa  219  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  41.92 
 
 		 581 aa  210  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.94 
 
 		 762 aa  210  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  46 
 
 		 1441 aa  209  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  43.3 
 
 		 987 aa  206  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  39.75 
 
 		 850 aa  196  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.08 
 
 		 962 aa  194  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  40.26 
 
 		 578 aa  192  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 752 aa  192  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  49.24 
 
 		 815 aa  190  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.51 
 
 		 1158 aa  185  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04360  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  29.98 
 
 		 618 aa  184  8.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.117639 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  29.72 
 
 		 737 aa  184  9.000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2442  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.63 
 
 		 742 aa  184  9.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2344  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.11 
 
 		 608 aa  184  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  38.03 
 
 		 588 aa  179  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.01 
 
 		 915 aa  177  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  27.67 
 
 		 727 aa  172  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  27.67 
 
 		 727 aa  172  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1250  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.44 
 
 		 644 aa  170  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01804  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  26.12 
 
 		 618 aa  167  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.497793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2978  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.95 
 
 		 609 aa  167  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  26.64 
 
 		 743 aa  165  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  28.52 
 
 		 618 aa  164  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2291  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.27 
 
 		 733 aa  164  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3307  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.04 
 
 		 659 aa  163  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2616  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.55 
 
 		 615 aa  163  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  28.83 
 
 		 766 aa  163  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  26.13 
 
 		 740 aa  162  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  27.85 
 
 		 750 aa  163  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.26 
 
 		 783 aa  162  7e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  34.98 
 
 		 4013 aa  161  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  25.85 
 
 		 743 aa  160  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.14 
 
 		 702 aa  161  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2514  glycoside hydrolase family 3 protein  28.23 
 
 		 743 aa  161  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0628734 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3725  glycosy hydrolase family protein  28.23 
 
 		 605 aa  160  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.91 
 
 		 1362 aa  158  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.29 
 
 		 766 aa  157  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  27.32 
 
 		 777 aa  156  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  26.28 
 
 		 745 aa  156  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  28.18 
 
 		 750 aa  155  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2737  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.75 
 
 		 743 aa  155  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.728913 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6710  Beta-glucosidase  25.42 
 
 		 671 aa  154  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.593883 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3149  Beta-glucosidase  26.91 
 
 		 663 aa  153  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167157  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  27.02 
 
 		 772 aa  154  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2741  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.78 
 
 		 670 aa  153  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  28.16 
 
 		 751 aa  153  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3250  glycoside hydrolase family 3 protein  28.21 
 
 		 588 aa  152  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.67 
 
 		 736 aa  152  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2446  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.27 
 
 		 659 aa  152  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.802964  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  26.02 
 
 		 758 aa  152  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.17 
 
 		 723 aa  150  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.49 
 
 		 756 aa  150  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  25.89 
 
 		 778 aa  150  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.66 
 
 		 769 aa  150  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.24 
 
 		 754 aa  149  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  27.59 
 
 		 721 aa  149  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.83 
 
 		 733 aa  148  9e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2365  xylosidase/arabinosidase  28.49 
 
 		 759 aa  148  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.327511  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  26.51 
 
 		 765 aa  147  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  25.84 
 
 		 772 aa  147  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03794  glucan 1,4-beta-glucosidase  26.45 
 
 		 850 aa  147  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  26.51 
 
 		 755 aa  147  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  27.38 
 
 		 764 aa  146  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4300  Beta-glucosidase  25.74 
 
 		 669 aa  146  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0170448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.46 
 
 		 804 aa  145  5e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  26.51 
 
 		 755 aa  145  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  26.51 
 
 		 755 aa  145  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  26.51 
 
 		 765 aa  145  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  26.51 
 
 		 765 aa  145  9e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.98 
 
 		 769 aa  144  9e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  26.51 
 
 		 765 aa  145  9e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  26.51 
 
 		 765 aa  145  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  26.33 
 
 		 765 aa  144  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.33 
 
 		 765 aa  144  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.48 
 
 		 784 aa  144  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  26.33 
 
 		 765 aa  144  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.71 
 
 		 751 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  26.33 
 
 		 765 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00680  glucan 1,4-beta-glucosidase  26.64 
 
 		 844 aa  144  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  25.57 
 
 		 778 aa  144  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  26.33 
 
 		 755 aa  144  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.45 
 
 		 771 aa  144  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.64 
 
 		 792 aa  143  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.86 
 
 		 795 aa  142  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  27.47 
 
 		 763 aa  141  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  29.8 
 
 		 966 aa  140  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  26.16 
 
 		 765 aa  140  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.27 
 
 		 752 aa  140  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3526  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.79 
 
 		 727 aa  140  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.045935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2687  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.6 
 
 		 677 aa  139  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1318  Beta-glucosidase  27.42 
 
 		 880 aa  139  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0397  Beta-glucosidase-related glycosidase  26 
 
 		 760 aa  139  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000776871 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  26.85 
 
 		 774 aa  138  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2541  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.57 
 
 		 658 aa  138  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.39 
 
 		 751 aa  138  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  27.33 
 
 		 759 aa  137  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  26.33 
 
 		 765 aa  137  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>