226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3395 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  100 
 
 
588 aa  1187    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  35.3 
 
 
752 aa  307  3e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  54.22 
 
 
674 aa  291  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  54.93 
 
 
987 aa  287  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  52.23 
 
 
962 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  48.79 
 
 
581 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  51.08 
 
 
578 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  47.87 
 
 
850 aa  259  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  57.71 
 
 
815 aa  255  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  53.35 
 
 
1158 aa  248  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  50.2 
 
 
283 aa  246  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  48.45 
 
 
289 aa  243  9e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  49.8 
 
 
423 aa  242  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  51.19 
 
 
426 aa  236  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  45.39 
 
 
282 aa  228  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  45.59 
 
 
641 aa  226  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  45.59 
 
 
642 aa  226  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  45.14 
 
 
627 aa  216  7e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  44.53 
 
 
288 aa  216  7e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  42.86 
 
 
1290 aa  200  6e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  64.71 
 
 
433 aa  199  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  45.06 
 
 
291 aa  199  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  42.96 
 
 
279 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  45.56 
 
 
281 aa  196  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  35.39 
 
 
1581 aa  194  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  40.44 
 
 
1441 aa  194  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.21 
 
 
1007 aa  194  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.19 
 
 
915 aa  192  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  61.45 
 
 
449 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  41.13 
 
 
274 aa  184  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  40.47 
 
 
569 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  40.7 
 
 
1321 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  37.31 
 
 
999 aa  180  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  40.86 
 
 
883 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.36 
 
 
1564 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  40.3 
 
 
286 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  42.47 
 
 
633 aa  170  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  61.97 
 
 
755 aa  170  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  68.66 
 
 
940 aa  170  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  61.03 
 
 
722 aa  170  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  36.73 
 
 
4013 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  38.43 
 
 
383 aa  168  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  39.77 
 
 
269 aa  167  5.9999999999999996e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  37.92 
 
 
556 aa  165  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  52.05 
 
 
571 aa  165  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.21 
 
 
252 aa  164  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  37.54 
 
 
1028 aa  162  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  37.89 
 
 
1059 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  40.08 
 
 
384 aa  161  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  70.73 
 
 
639 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  42.15 
 
 
260 aa  159  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  39.22 
 
 
409 aa  158  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  39.22 
 
 
389 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  40.61 
 
 
276 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  59.52 
 
 
953 aa  154  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  59.52 
 
 
392 aa  153  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  35.71 
 
 
469 aa  151  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  38.85 
 
 
271 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.23 
 
 
819 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  36.16 
 
 
394 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  58.06 
 
 
756 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.33 
 
 
742 aa  146  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  38.77 
 
 
286 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  35.84 
 
 
578 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  34.46 
 
 
328 aa  145  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  52.38 
 
 
637 aa  144  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  34.8 
 
 
330 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  34.46 
 
 
1028 aa  142  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  38.18 
 
 
291 aa  143  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  37.8 
 
 
286 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.17 
 
 
358 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  34.75 
 
 
694 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  36.96 
 
 
301 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.8 
 
 
290 aa  137  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  36.15 
 
 
503 aa  137  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 
1332 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.59 
 
 
261 aa  134  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  55.64 
 
 
452 aa  134  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  37.17 
 
 
427 aa  134  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.46 
 
 
328 aa  133  7.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.46 
 
 
532 aa  133  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  54.92 
 
 
929 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.21 
 
 
1362 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  34.21 
 
 
275 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.15 
 
 
306 aa  128  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  34.42 
 
 
308 aa  126  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  28.79 
 
 
1471 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.78 
 
 
884 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  30.92 
 
 
346 aa  124  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.8 
 
 
1321 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  47.58 
 
 
1070 aa  124  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.45 
 
 
547 aa  124  7e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.24 
 
 
912 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.49 
 
 
315 aa  121  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  55.56 
 
 
1059 aa  121  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.75 
 
 
1694 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  32.1 
 
 
313 aa  117  6.9999999999999995e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.26 
 
 
729 aa  117  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  40.76 
 
 
801 aa  117  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  50 
 
 
1103 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>