256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4545 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  100 
 
 
383 aa  777    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  61.5 
 
 
389 aa  487  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  55.06 
 
 
409 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  46.24 
 
 
633 aa  226  7e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  47.83 
 
 
274 aa  224  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  46.67 
 
 
279 aa  219  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  49.15 
 
 
291 aa  216  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  43.87 
 
 
642 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  43.87 
 
 
641 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  45.16 
 
 
281 aa  209  7e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  43.15 
 
 
627 aa  208  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  42.29 
 
 
1059 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  41.5 
 
 
1290 aa  203  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  42.52 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  45.06 
 
 
556 aa  198  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  42.91 
 
 
288 aa  196  7e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  44.54 
 
 
423 aa  192  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  46.28 
 
 
569 aa  192  9e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  42.91 
 
 
282 aa  191  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  44.92 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  44.26 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  43.5 
 
 
883 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  37.06 
 
 
470 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  41.22 
 
 
283 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  39.04 
 
 
1321 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  42.97 
 
 
301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  43.85 
 
 
426 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.09 
 
 
819 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  40.07 
 
 
1028 aa  174  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  38.43 
 
 
384 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  41.39 
 
 
742 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  33.03 
 
 
479 aa  168  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  38.43 
 
 
588 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  31.97 
 
 
479 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  43.22 
 
 
286 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  41.84 
 
 
503 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  37.87 
 
 
328 aa  162  8.000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  36.5 
 
 
405 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  36.55 
 
 
291 aa  159  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.37 
 
 
358 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  40.91 
 
 
547 aa  157  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.49 
 
 
532 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  35.79 
 
 
1332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  41.7 
 
 
286 aa  156  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  40 
 
 
1441 aa  155  8e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  36.65 
 
 
694 aa  155  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.27 
 
 
261 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.87 
 
 
1694 aa  154  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  31.85 
 
 
464 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  37.59 
 
 
469 aa  150  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  35.71 
 
 
330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  39.34 
 
 
467 aa  146  6e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.87 
 
 
306 aa  146  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  35.71 
 
 
1918 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  51.75 
 
 
541 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  58.4 
 
 
465 aa  142  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  56.8 
 
 
884 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  33.64 
 
 
394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  57.85 
 
 
957 aa  139  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  35.77 
 
 
286 aa  139  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.97 
 
 
912 aa  137  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  32.37 
 
 
469 aa  137  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  53.72 
 
 
536 aa  136  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  35.68 
 
 
752 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.38 
 
 
884 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.8 
 
 
328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  34.88 
 
 
271 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  36.4 
 
 
260 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  53.23 
 
 
610 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  35.44 
 
 
238 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.94 
 
 
290 aa  127  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  30.1 
 
 
313 aa  127  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  33.7 
 
 
275 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.33 
 
 
315 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  53.23 
 
 
726 aa  123  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  33.72 
 
 
269 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  36.69 
 
 
539 aa  119  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  34.19 
 
 
318 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  50.83 
 
 
705 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  29.84 
 
 
277 aa  113  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  49.15 
 
 
1132 aa  113  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  29.94 
 
 
1707 aa  113  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  51.72 
 
 
673 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  33.44 
 
 
388 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  29.93 
 
 
427 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  34.87 
 
 
722 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  29.27 
 
 
263 aa  106  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  42.37 
 
 
1167 aa  103  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  28.19 
 
 
346 aa  102  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  33.98 
 
 
446 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  27.11 
 
 
319 aa  99.8  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  45.76 
 
 
1391 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  30.65 
 
 
449 aa  97.8  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.85 
 
 
1007 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  49.55 
 
 
461 aa  97.1  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.49 
 
 
639 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  45 
 
 
869 aa  93.2  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  31.98 
 
 
275 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  31.64 
 
 
308 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  41.73 
 
 
877 aa  88.2  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>