139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1600 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  100 
 
 
288 aa  588  1e-167  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  68.25 
 
 
282 aa  352  5e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  55.56 
 
 
641 aa  293  3e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  55.56 
 
 
642 aa  293  3e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  51.61 
 
 
281 aa  262  4.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  47.81 
 
 
279 aa  257  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  50.8 
 
 
1290 aa  256  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  47.18 
 
 
627 aa  251  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  50.21 
 
 
291 aa  251  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  44.06 
 
 
274 aa  225  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  46.37 
 
 
283 aa  222  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  47.6 
 
 
633 aa  217  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  45.93 
 
 
289 aa  216  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  44.92 
 
 
588 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  39.45 
 
 
423 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  44.84 
 
 
1321 aa  211  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  44.76 
 
 
426 aa  209  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  45.31 
 
 
383 aa  209  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  40.35 
 
 
276 aa  199  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  43.43 
 
 
569 aa  199  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  41.96 
 
 
883 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  43.41 
 
 
389 aa  195  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  40.81 
 
 
252 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  38.8 
 
 
384 aa  183  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  42.11 
 
 
409 aa  180  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  39.65 
 
 
503 aa  179  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  38.97 
 
 
328 aa  179  5.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  41.94 
 
 
556 aa  177  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  41.37 
 
 
301 aa  176  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  39.13 
 
 
1694 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  37.01 
 
 
1028 aa  170  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  42.86 
 
 
286 aa  169  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  38.38 
 
 
394 aa  167  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.26 
 
 
358 aa  165  9e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  37.37 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  34.62 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.28 
 
 
532 aa  161  9e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  38.4 
 
 
1059 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.9 
 
 
306 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  38.95 
 
 
330 aa  155  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  37.23 
 
 
260 aa  155  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  32.92 
 
 
694 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  37.89 
 
 
752 aa  152  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  38.28 
 
 
1332 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.58 
 
 
912 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.77 
 
 
819 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  36.05 
 
 
286 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.66 
 
 
315 aa  149  6e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.28 
 
 
884 aa  149  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  34.98 
 
 
469 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.36 
 
 
742 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.48 
 
 
261 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  35.08 
 
 
269 aa  145  9e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  37.93 
 
 
286 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  35.8 
 
 
238 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.71 
 
 
547 aa  140  3.9999999999999997e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  38.37 
 
 
308 aa  139  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  38.55 
 
 
1441 aa  137  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.42 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  33.81 
 
 
1918 aa  129  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  32.69 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.77 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  30.85 
 
 
427 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  35.98 
 
 
275 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  32.5 
 
 
405 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  30.99 
 
 
1707 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  35.55 
 
 
320 aa  116  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  34.29 
 
 
467 aa  116  5e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  31.7 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  32.22 
 
 
608 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  27.33 
 
 
306 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  31.64 
 
 
263 aa  106  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  32.46 
 
 
907 aa  105  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  30.47 
 
 
346 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  32.37 
 
 
465 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.533696 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  32.11 
 
 
388 aa  103  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  30.03 
 
 
477 aa  102  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  30.53 
 
 
475 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  29.55 
 
 
464 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  31.29 
 
 
470 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  30.13 
 
 
479 aa  99  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  31.12 
 
 
318 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  27.78 
 
 
277 aa  98.2  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  28.24 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3127  glycoside hydrolase family 16  29.41 
 
 
275 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  27.13 
 
 
842 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  27.61 
 
 
275 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  31.18 
 
 
479 aa  89.7  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  30.36 
 
 
295 aa  89.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.64 
 
 
639 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  27.41 
 
 
449 aa  87.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2578  glycoside hydrolase family protein  27.82 
 
 
277 aa  87.4  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164191  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  28.57 
 
 
319 aa  87.4  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  29.1 
 
 
446 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  32.06 
 
 
686 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  28.36 
 
 
539 aa  83.6  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0392  glycoside hydrolase family 16  31.95 
 
 
691 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  27.17 
 
 
469 aa  81.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6754  glycoside hydrolase family protein  23.83 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  28.52 
 
 
722 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>