More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1614 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 1471 aa  3002    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2136  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  32.66 
 
 		 756 aa  401  9.999999999999999e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.386965  normal  0.21464 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1442  putative hyaluronidase  48.45 
 
 		 1001 aa  315  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.980629  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7462  hypothetical protein  33.62 
 
 		 449 aa  249  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.510583 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  50.44 
 
 		 1173 aa  211  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0390  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  28.28 
 
 		 503 aa  201  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.584277 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1248  fibronectin type III domain-containing protein  52.4 
 
 		 205 aa  192  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0859  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  56.14 
 
 		 2095 aa  190  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  63.12 
 
 		 2095 aa  189  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.32 
 
 		 756 aa  186  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  35.56 
 
 		 1965 aa  186  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1472  putative alpha-N-acetylgalactosaminidase  31.78 
 
 		 1588 aa  186  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  33.75 
 
 		 752 aa  154  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02424  beta-N-hexosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00640)  27.56 
 
 		 773 aa  148  7.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0398118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.33 
 
 		 674 aa  139  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  31.37 
 
 		 578 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0687  fibronectin type III domain-containing protein  64.36 
 
 		 159 aa  133  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  34.92 
 
 		 987 aa  129  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  33.33 
 
 		 1581 aa  127  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0685  fibronectin type III domain-containing protein  68.67 
 
 		 1686 aa  123  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.68 
 
 		 962 aa  122  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  30.03 
 
 		 581 aa  122  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  24.7 
 
 		 558 aa  117  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.27 
 
 		 1158 aa  115  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.89 
 
 		 1362 aa  114  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.9 
 
 		 815 aa  114  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.64 
 
 		 762 aa  112  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.65 
 
 		 688 aa  112  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.31 
 
 		 593 aa  112  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.72 
 
 		 795 aa  108  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  24.94 
 
 		 816 aa  109  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.47 
 
 		 765 aa  108  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0815  glycosy hydrolase family protein  57.83 
 
 		 1127 aa  107  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.92 
 
 		 775 aa  107  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.46 
 
 		 613 aa  106  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.71 
 
 		 760 aa  105  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.49 
 
 		 779 aa  105  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.86 
 
 		 528 aa  104  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  28.18 
 
 		 588 aa  104  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.72 
 
 		 905 aa  104  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.39 
 
 		 542 aa  104  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.81 
 
 		 605 aa  104  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.68 
 
 		 772 aa  103  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  26.73 
 
 		 850 aa  103  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.15 
 
 		 504 aa  102  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  24.38 
 
 		 777 aa  101  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.22 
 
 		 636 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  29.25 
 
 		 578 aa  101  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.49 
 
 		 858 aa  100  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.93 
 
 		 584 aa  101  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  28.52 
 
 		 637 aa  100  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.18 
 
 		 781 aa  100  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.73 
 
 		 673 aa  100  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.85 
 
 		 549 aa  100  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  30.4 
 
 		 1441 aa  99.4  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  29.1 
 
 		 639 aa  99.8  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.67 
 
 		 821 aa  99  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.17 
 
 		 549 aa  98.6  7e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.66 
 
 		 618 aa  99  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.34 
 
 		 774 aa  98.6  8e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.23 
 
 		 665 aa  97.8  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  25 
 
 		 807 aa  98.2  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.06 
 
 		 553 aa  97.8  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.17 
 
 		 493 aa  97.4  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.74 
 
 		 515 aa  97.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.37 
 
 		 673 aa  96.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.67 
 
 		 915 aa  96.3  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1924  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.07 
 
 		 664 aa  95.9  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.234624  decreased coverage  0.00104389 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1815  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.48 
 
 		 728 aa  95.9  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0101329  normal  0.0951479 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.53 
 
 		 634 aa  95.1  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.02 
 
 		 534 aa  93.6  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1885  S-layer domain protein  38.19 
 
 		 591 aa  94  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.726885  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.91 
 
 		 688 aa  94.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.12 
 
 		 627 aa  93.6  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.67 
 
 		 811 aa  94.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.57 
 
 		 533 aa  93.6  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1424  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.61 
 
 		 643 aa  94.4  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.96 
 
 		 609 aa  93.2  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  25.85 
 
 		 614 aa  93.6  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.99 
 
 		 766 aa  93.2  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  32.05 
 
 		 1028 aa  93.2  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.46 
 
 		 1564 aa  92.8  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.73 
 
 		 529 aa  92.8  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.97 
 
 		 797 aa  92.8  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.87 
 
 		 812 aa  92.8  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  24.14 
 
 		 525 aa  92.4  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  23.59 
 
 		 896 aa  92.4  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.85 
 
 		 755 aa  92  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32069  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  21.7 
 
 		 614 aa  91.7  9e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.28283 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.63 
 
 		 683 aa  91.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.87 
 
 		 812 aa  91.7  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.4 
 
 		 636 aa  90.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.62 
 
 		 785 aa  90.5  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.35 
 
 		 618 aa  90.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  23.04 
 
 		 639 aa  90.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3250  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.46 
 
 		 651 aa  90.1  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0167827  decreased coverage  0.00105641 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  24.09 
 
 		 602 aa  90.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  25.61 
 
 		 639 aa  90.1  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.14 
 
 		 422 aa  90.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  25 
 
 		 533 aa  89.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>