60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0532 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  100 
 
 		 1173 aa  2370    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0721  putative exo-alpha-sialidase  57.21 
 
 		 694 aa  724    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1932  neuraminidase-related protein  33.68 
 
 		 816 aa  231  6e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00773567  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  50.44 
 
 		 1471 aa  211  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1442  putative hyaluronidase  47.11 
 
 		 1001 aa  193  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.980629  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1248  fibronectin type III domain-containing protein  48.79 
 
 		 205 aa  180  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  36.76 
 
 		 559 aa  138  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1472  putative alpha-N-acetylgalactosaminidase  66.67 
 
 		 1588 aa  131  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0016  Exo-alpha-sialidase  33.97 
 
 		 515 aa  126  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0687  fibronectin type III domain-containing protein  50 
 
 		 159 aa  125  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  52.88 
 
 		 1965 aa  125  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2214  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 549 aa  124  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0859  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  36.44 
 
 		 2095 aa  117  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  56.99 
 
 		 2095 aa  115  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0685  fibronectin type III domain-containing protein  64.29 
 
 		 1686 aa  115  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1703  Exo-alpha-sialidase  32.38 
 
 		 391 aa  112  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.137706  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0815  glycosy hydrolase family protein  55.45 
 
 		 1127 aa  112  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3253  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  32.79 
 
 		 523 aa  109  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  normal  0.018694 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1835  Exo-alpha-sialidase  30.97 
 
 		 674 aa  104  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  31.95 
 
 		 419 aa  104  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  27.34 
 
 		 1015 aa  100  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2856  Neuraminidase (sialidase)-like protein  26.91 
 
 		 425 aa  96.7  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.832165  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  26.02 
 
 		 978 aa  95.1  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0189  exo-alpha-sialidase  26.7 
 
 		 589 aa  92  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1885  S-layer domain protein  40.62 
 
 		 591 aa  91.3  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.726885  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1440  Exo-alpha-sialidase  29.15 
 
 		 391 aa  87.8  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 397 aa  86.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3385  Exo-alpha-sialidase  30.95 
 
 		 558 aa  85.9  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  27.21 
 
 		 399 aa  80.9  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1515  exo-alpha-sialidase  28.02 
 
 		 949 aa  79.7  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5835  Exo-alpha-sialidase  25.94 
 
 		 392 aa  76.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08300  BNR/Asp-box repeat protein  29.63 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195911  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0352  sialidase, putative  28.14 
 
 		 526 aa  73.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0283127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  36.89 
 
 		 850 aa  69.3  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30 
 
 		 1264 aa  68.6  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  25.63 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08290  hypothetical protein  26.59 
 
 		 377 aa  67.8  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0551571  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.84 
 
 		 1289 aa  65.1  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  33.88 
 
 		 805 aa  63.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1914  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 472 aa  60.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2227  hypothetical protein  29.82 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2216  hypothetical protein  28.24 
 
 		 652 aa  56.6  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0285  endo-beta-N-acetylglucosaminidase  38.75 
 
 		 1135 aa  55.5  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.06 
 
 		 704 aa  55.1  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4992  hypothetical protein  27.94 
 
 		 597 aa  54.7  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1674  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.82 
 
 		 1970 aa  54.7  0.000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0471  BNR domain-containing protein  26.37 
 
 		 543 aa  52  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1008  glycoside hydrolase family 31  27.84 
 
 		 1311 aa  49.3  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.590426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  30.85 
 
 		 3699 aa  48.9  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  30.85 
 
 		 2503 aa  48.9  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  26.02 
 
 		 2142 aa  48.5  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.52 
 
 		 1329 aa  48.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0985  sialidase  27.38 
 
 		 382 aa  48.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00120415  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  36.23 
 
 		 1221 aa  47.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3584  hypothetical protein  24.68 
 
 		 583 aa  48.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.632937 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  36.23 
 
 		 780 aa  47.8  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.79 
 
 		 3699 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1759  BNR/Asp-box repeat-containing protein  25.48 
 
 		 571 aa  47.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00340531  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  30.93 
 
 		 2334 aa  45.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  22.73 
 
 		 3544 aa  44.7  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>