31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0721 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  57.21 
 
 
1173 aa  724    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0721  putative exo-alpha-sialidase  100 
 
 
694 aa  1405    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1932  neuraminidase-related protein  36.36 
 
 
816 aa  278  2e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00773567  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2214  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.72 
 
 
549 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  34.34 
 
 
559 aa  132  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1835  Exo-alpha-sialidase  29.23 
 
 
674 aa  132  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1703  Exo-alpha-sialidase  34.24 
 
 
391 aa  124  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.137706  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3253  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.34 
 
 
523 aa  124  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  normal  0.018694 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2856  Neuraminidase (sialidase)-like protein  26.35 
 
 
425 aa  118  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.832165  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0016  Exo-alpha-sialidase  33.83 
 
 
515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.34 
 
 
397 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0189  exo-alpha-sialidase  26.89 
 
 
589 aa  103  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  30 
 
 
419 aa  102  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  26.07 
 
 
978 aa  101  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  26.85 
 
 
1015 aa  97.4  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5835  Exo-alpha-sialidase  28.85 
 
 
392 aa  89  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  27.08 
 
 
399 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1914  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.87 
 
 
472 aa  81.3  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1515  exo-alpha-sialidase  28.52 
 
 
949 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3385  Exo-alpha-sialidase  26.46 
 
 
558 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  27.74 
 
 
388 aa  78.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08300  BNR/Asp-box repeat protein  26.09 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195911  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1440  Exo-alpha-sialidase  28.06 
 
 
391 aa  74.3  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0352  sialidase, putative  28.92 
 
 
526 aa  71.2  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0283127 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08290  hypothetical protein  23.62 
 
 
377 aa  64.7  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0551571  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0471  BNR domain-containing protein  41.18 
 
 
543 aa  61.2  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2227  hypothetical protein  25.87 
 
 
421 aa  58.9  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735505  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1436  neuramidase  22.93 
 
 
367 aa  52.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.816222  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1381  neuraminidase  25.51 
 
 
807 aa  48.1  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0985  sialidase  28.4 
 
 
382 aa  47.4  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00120415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0877  sialidase  27.19 
 
 
382 aa  45.8  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0420038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>