36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0877 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0985  sialidase  96.86 
 
 		 382 aa  758    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00120415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0877  sialidase  100 
 
 		 382 aa  779    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0420038  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0005  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 857 aa  182  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1835  Exo-alpha-sialidase  33.24 
 
 		 674 aa  149  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1211  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 757 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2214  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 549 aa  113  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 559 aa  113  7.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0016  Exo-alpha-sialidase  28.42 
 
 		 515 aa  104  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1703  Exo-alpha-sialidase  30.07 
 
 		 391 aa  89.7  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.137706  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3253  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  30.54 
 
 		 523 aa  89.7  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  normal  0.018694 
 
 
-
 
NC_002950  PG0352  sialidase, putative  29.32 
 
 		 526 aa  84  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0283127 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1515  exo-alpha-sialidase  31.6 
 
 		 949 aa  77  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08300  BNR/Asp-box repeat protein  29.25 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195911  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  25.69 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2856  Neuraminidase (sialidase)-like protein  26.23 
 
 		 425 aa  72  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.832165  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3385  Exo-alpha-sialidase  27.31 
 
 		 558 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5835  Exo-alpha-sialidase  27.17 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0189  exo-alpha-sialidase  27.31 
 
 		 589 aa  66.6  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2227  hypothetical protein  26.81 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  25.77 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0471  BNR domain-containing protein  27.15 
 
 		 543 aa  57.8  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2216  hypothetical protein  29.73 
 
 		 652 aa  57  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1440  Exo-alpha-sialidase  24.63 
 
 		 391 aa  53.1  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2712  hypothetical protein  24.3 
 
 		 509 aa  51.6  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  25.19 
 
 		 978 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  24.69 
 
 		 419 aa  51.6  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  23.95 
 
 		 1015 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0721  putative exo-alpha-sialidase  26.25 
 
 		 694 aa  50.4  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08290  hypothetical protein  24.02 
 
 		 377 aa  50.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0551571  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1914  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.36 
 
 		 472 aa  48.5  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25 
 
 		 383 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1900  hypothetical protein  25.74 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  28.83 
 
 		 1173 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6956  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.99 
 
 		 395 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1253  hypothetical protein  25.21 
 
 		 437 aa  42.7  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.237005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>