36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5835 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5835  Exo-alpha-sialidase  100 
 
 
392 aa  791    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1440  Exo-alpha-sialidase  47.21 
 
 
391 aa  312  5.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1703  Exo-alpha-sialidase  37.47 
 
 
391 aa  225  8e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.137706  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  35.88 
 
 
559 aa  188  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1436  neuramidase  35.93 
 
 
367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.816222  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  33.06 
 
 
397 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  32.43 
 
 
388 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2856  Neuraminidase (sialidase)-like protein  32.34 
 
 
425 aa  144  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.832165  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2214  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.32 
 
 
549 aa  129  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1835  Exo-alpha-sialidase  31.22 
 
 
674 aa  129  9.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  31.54 
 
 
399 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0016  Exo-alpha-sialidase  27.39 
 
 
515 aa  125  9e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1515  exo-alpha-sialidase  29.48 
 
 
949 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  30 
 
 
419 aa  125  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3385  Exo-alpha-sialidase  31.35 
 
 
558 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2227  hypothetical protein  31.79 
 
 
421 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735505  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3253  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.3 
 
 
523 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  normal  0.018694 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  30.73 
 
 
978 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  31.22 
 
 
1015 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0352  sialidase, putative  26.15 
 
 
526 aa  98.2  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0283127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0189  exo-alpha-sialidase  29.28 
 
 
589 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08290  hypothetical protein  30.81 
 
 
377 aa  91.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0551571  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0721  putative exo-alpha-sialidase  28.85 
 
 
694 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08300  BNR/Asp-box repeat protein  29.5 
 
 
408 aa  85.5  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195911  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  25.94 
 
 
1173 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.42 
 
 
383 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2712  hypothetical protein  27.56 
 
 
509 aa  72.4  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0471  BNR domain-containing protein  26.49 
 
 
543 aa  70.9  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0985  sialidase  26.56 
 
 
382 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00120415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0877  sialidase  27.17 
 
 
382 aa  69.7  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0420038  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1914  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.1 
 
 
472 aa  62.4  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2216  hypothetical protein  28.43 
 
 
652 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1932  neuraminidase-related protein  33.98 
 
 
816 aa  61.2  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00773567  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1900  hypothetical protein  25.28 
 
 
384 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398807  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1381  neuraminidase  30.11 
 
 
807 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0623  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.34 
 
 
436 aa  48.5  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.815723  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>