40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0016 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0016  Exo-alpha-sialidase  100 
 
 		 515 aa  1072    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3253  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  44.15 
 
 		 523 aa  375  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  normal  0.018694 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2214  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  41.2 
 
 		 549 aa  352  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1835  Exo-alpha-sialidase  43.9 
 
 		 674 aa  345  1e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2856  Neuraminidase (sialidase)-like protein  44.29 
 
 		 425 aa  316  7e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.832165  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 559 aa  194  5e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1703  Exo-alpha-sialidase  32.97 
 
 		 391 aa  180  5.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.137706  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 397 aa  159  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  29.38 
 
 		 978 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  29.97 
 
 		 388 aa  130  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  33.97 
 
 		 1173 aa  126  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0352  sialidase, putative  27.66 
 
 		 526 aa  125  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0283127 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1515  exo-alpha-sialidase  26.54 
 
 		 949 aa  126  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2227  hypothetical protein  30.55 
 
 		 421 aa  124  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3385  Exo-alpha-sialidase  29.66 
 
 		 558 aa  123  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  28.77 
 
 		 1015 aa  123  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5835  Exo-alpha-sialidase  28.25 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08300  BNR/Asp-box repeat protein  28.68 
 
 		 408 aa  116  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195911  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0721  putative exo-alpha-sialidase  33.83 
 
 		 694 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0189  exo-alpha-sialidase  25.63 
 
 		 589 aa  111  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  28.64 
 
 		 399 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08290  hypothetical protein  27.62 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0551571  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0877  sialidase  28.42 
 
 		 382 aa  104  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0420038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0985  sialidase  28.69 
 
 		 382 aa  104  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00120415  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1440  Exo-alpha-sialidase  29.57 
 
 		 391 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0471  BNR domain-containing protein  26.22 
 
 		 543 aa  82  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  25.14 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2712  hypothetical protein  27.17 
 
 		 509 aa  81.6  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1914  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 472 aa  77.8  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1932  neuraminidase-related protein  27.57 
 
 		 816 aa  76.6  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00773567  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0005  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 857 aa  72.4  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1436  neuramidase  22.84 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.816222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1381  neuraminidase  26.64 
 
 		 807 aa  59.3  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1900  hypothetical protein  27.91 
 
 		 384 aa  57  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1324  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.21 
 
 		 354 aa  53.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.12068  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 383 aa  51.2  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1211  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 757 aa  48.9  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2779  exported exo-alpha-sialidase  23.43 
 
 		 378 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4186  BNR/Asp-box repeat-containing protein  25.09 
 
 		 481 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  25.43 
 
 		 823 aa  44.3  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>