39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1900 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1900  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  792    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1899  hypothetical protein  27.73 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.20123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1835  Exo-alpha-sialidase  24.92 
 
 		 674 aa  64.3  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1324  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.34 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.12068  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0644  hypothetical protein  25.3 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175694  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1515  exo-alpha-sialidase  24.73 
 
 		 949 aa  60.5  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0687  hypothetical protein  24.6 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  34.84 
 
 		 823 aa  60.1  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5835  Exo-alpha-sialidase  25.28 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6297  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.55 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.715127 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25 
 
 		 559 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1532  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.55 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6956  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.55 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  25.31 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0016  Exo-alpha-sialidase  27.91 
 
 		 515 aa  57  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12450  hypothetical protein  26.21 
 
 		 933 aa  56.6  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.277877  normal  0.37002 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3540  hypothetical protein  25.81 
 
 		 395 aa  57  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.326221  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3711  hypothetical protein  25.56 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2148  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.83 
 
 		 361 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1703  Exo-alpha-sialidase  24.01 
 
 		 391 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.137706  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2712  hypothetical protein  23.86 
 
 		 509 aa  53.9  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2856  Neuraminidase (sialidase)-like protein  23.37 
 
 		 425 aa  53.5  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.832165  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4078  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.47 
 
 		 381 aa  53.5  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2606  hypothetical protein  29.1 
 
 		 362 aa  53.5  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.115188 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8131  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.12 
 
 		 398 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1110  hypothetical protein  25.7 
 
 		 413 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1043  hypothetical protein  25.94 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0352  sialidase, putative  22.82 
 
 		 526 aa  48.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0283127 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3089  signal peptide prediction  23.46 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  25.6 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0562  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270788  normal  0.469707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3583  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.58 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.436734 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0877  sialidase  25.74 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0420038  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1440  Exo-alpha-sialidase  22.99 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0372  bifunctional protein (secreted sugar binding protein/sugar hydrolase)  30.61 
 
 		 394 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.785262 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0985  sialidase  25.37 
 
 		 382 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00120415  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5595  hypothetical protein  27.42 
 
 		 364 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  23.91 
 
 		 668 aa  43.5  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>