45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3384 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 978 aa  1964    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  71.88 
 
 		 1015 aa  1424    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08300  BNR/Asp-box repeat protein  46.4 
 
 		 408 aa  301  5e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195911  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08290  hypothetical protein  41.79 
 
 		 377 aa  236  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0551571  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3385  Exo-alpha-sialidase  38.02 
 
 		 558 aa  206  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0189  exo-alpha-sialidase  37.2 
 
 		 589 aa  197  9e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 397 aa  152  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 559 aa  151  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2856  Neuraminidase (sialidase)-like protein  33.96 
 
 		 425 aa  149  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.832165  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1835  Exo-alpha-sialidase  30.83 
 
 		 674 aa  143  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1703  Exo-alpha-sialidase  32.09 
 
 		 391 aa  140  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.137706  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  31.96 
 
 		 388 aa  137  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0016  Exo-alpha-sialidase  29.38 
 
 		 515 aa  135  6e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0352  sialidase, putative  31.34 
 
 		 526 aa  131  7.000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0283127 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1515  exo-alpha-sialidase  32.43 
 
 		 949 aa  128  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2214  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 549 aa  122  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  29.83 
 
 		 419 aa  119  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  28.99 
 
 		 399 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1914  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 472 aa  115  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3253  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 523 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  normal  0.018694 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2227  hypothetical protein  30.81 
 
 		 421 aa  112  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5835  Exo-alpha-sialidase  30.73 
 
 		 392 aa  101  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0721  putative exo-alpha-sialidase  26.07 
 
 		 694 aa  101  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2712  hypothetical protein  28.02 
 
 		 509 aa  100  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  26.02 
 
 		 1173 aa  94.7  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1440  Exo-alpha-sialidase  32.4 
 
 		 391 aa  94.7  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1436  neuramidase  29.54 
 
 		 367 aa  83.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.816222  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1932  neuraminidase-related protein  29.31 
 
 		 816 aa  77.8  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00773567  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0471  BNR domain-containing protein  28.13 
 
 		 543 aa  73.9  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2216  hypothetical protein  27.69 
 
 		 652 aa  66.6  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1381  neuraminidase  30.93 
 
 		 807 aa  64.7  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  25.66 
 
 		 823 aa  64.3  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  27.88 
 
 		 4896 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  31.78 
 
 		 1989 aa  58.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 383 aa  55.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0985  sialidase  24.15 
 
 		 382 aa  52.4  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00120415  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3584  hypothetical protein  23.22 
 
 		 583 aa  52.4  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.632937 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  27.02 
 
 		 3486 aa  51.2  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0877  sialidase  25.19 
 
 		 382 aa  51.2  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0420038  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0623  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.59 
 
 		 436 aa  47.8  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.815723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  37.18 
 
 		 1898 aa  47  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  26.52 
 
 		 8918 aa  46.2  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  35.11 
 
 		 3191 aa  45.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09240  conserved repeat protein  40.45 
 
 		 2912 aa  45.1  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0557  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.43 
 
 		 375 aa  44.7  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.560584 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>