43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0625 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  100 
 
 
419 aa  868    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  35.51 
 
 
559 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1703  Exo-alpha-sialidase  31.91 
 
 
391 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.137706  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  34.04 
 
 
397 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  29.64 
 
 
1015 aa  126  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5835  Exo-alpha-sialidase  30 
 
 
392 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  31.06 
 
 
388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  29.83 
 
 
978 aa  120  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1440  Exo-alpha-sialidase  28.68 
 
 
391 aa  117  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  30.46 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08300  BNR/Asp-box repeat protein  28.09 
 
 
408 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195911  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2227  hypothetical protein  27.08 
 
 
421 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735505  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1436  neuramidase  29.21 
 
 
367 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.816222  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  31.95 
 
 
1173 aa  104  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0721  putative exo-alpha-sialidase  30 
 
 
694 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2856  Neuraminidase (sialidase)-like protein  26.58 
 
 
425 aa  96.3  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.832165  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2216  hypothetical protein  29.92 
 
 
652 aa  94.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3253  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.61 
 
 
523 aa  94.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  normal  0.018694 
 
 
-
 
NC_002950  PG0352  sialidase, putative  27.6 
 
 
526 aa  94.4  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0283127 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08290  hypothetical protein  27.87 
 
 
377 aa  92.4  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0551571  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3385  Exo-alpha-sialidase  27.15 
 
 
558 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1515  exo-alpha-sialidase  26.58 
 
 
949 aa  92  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0189  exo-alpha-sialidase  25.47 
 
 
589 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1835  Exo-alpha-sialidase  30.68 
 
 
674 aa  83.6  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0016  Exo-alpha-sialidase  25.14 
 
 
515 aa  81.6  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1932  neuraminidase-related protein  28.23 
 
 
816 aa  80.1  0.00000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00773567  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2214  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.02 
 
 
549 aa  77.8  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1914  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.35 
 
 
472 aa  70.9  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2148  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.19 
 
 
361 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1900  hypothetical protein  25.31 
 
 
384 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398807  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25 
 
 
383 aa  57  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1381  neuraminidase  25.3 
 
 
807 aa  54.3  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0985  sialidase  25.1 
 
 
382 aa  53.1  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00120415  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0471  BNR domain-containing protein  23.64 
 
 
543 aa  52.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0877  sialidase  24.69 
 
 
382 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0420038  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1899  hypothetical protein  25.69 
 
 
399 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.20123  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2712  hypothetical protein  21.81 
 
 
509 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0623  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  21.88 
 
 
436 aa  47.8  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.815723  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  24.1 
 
 
823 aa  47.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2779  exported exo-alpha-sialidase  23.14 
 
 
378 aa  46.6  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01621  BNR/Asp-box repeat domain protein  22.65 
 
 
350 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4268  hypothetical protein  22.9 
 
 
366 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168613  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7180  putative neuraminidase  20.83 
 
 
370 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.832478  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>