45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7180 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7180  putative neuraminidase  100 
 
 
370 aa  766    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.832478  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01621  BNR/Asp-box repeat domain protein  49.26 
 
 
350 aa  324  1e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1808  BNR/Asp-box repeat domain protein  48.7 
 
 
348 aa  311  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2045  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  44.54 
 
 
349 aa  307  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2779  exported exo-alpha-sialidase  43.84 
 
 
378 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2148  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  44.73 
 
 
361 aa  290  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  44.11 
 
 
1251 aa  281  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4078  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  42.2 
 
 
381 aa  275  8e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4268  hypothetical protein  37.76 
 
 
366 aa  219  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168613  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3918  hypothetical protein  39.61 
 
 
350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2863  hypothetical protein  35.89 
 
 
371 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1371  hypothetical protein  34.73 
 
 
347 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.182179 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1356  putative cytoplasmic protein  34.73 
 
 
347 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0360732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1929  putative cytoplasmic protein  34.73 
 
 
347 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.733619  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1340  putative cytoplasmic protein  34.73 
 
 
347 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0562  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.46 
 
 
391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270788  normal  0.469707 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1246  BNR/Asp-box repeat-containing protein  31.79 
 
 
417 aa  119  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1532  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.52 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8131  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.28 
 
 
398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6297  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.52 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.715127 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6956  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.49 
 
 
395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02900  conserved hypothetical protein  28.88 
 
 
372 aa  114  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1110  BNR/Asp-box repeat protein  30.86 
 
 
413 aa  113  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5961  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.53 
 
 
395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1110  hypothetical protein  28.08 
 
 
413 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1043  hypothetical protein  28.76 
 
 
414 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3540  hypothetical protein  28.49 
 
 
395 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.326221  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0687  hypothetical protein  28.85 
 
 
393 aa  99.8  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6273  putative glycosyl hydrolase protein  27.82 
 
 
395 aa  99.4  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160576  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6450  putative glycosyl hydrolase protein  27.9 
 
 
394 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.645858  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0644  hypothetical protein  28.25 
 
 
391 aa  97.4  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175694  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3711  hypothetical protein  27.82 
 
 
395 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3075  BNR/Asp-box repeat-containing protein  27.99 
 
 
461 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1897  BNR/Asp-box repeat protein  27.05 
 
 
432 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.417517  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3508  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.88 
 
 
432 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3984  hypothetical protein  24.47 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0557  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.07 
 
 
375 aa  79  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.560584 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07930  conserved hypothetical protein  26.51 
 
 
333 aa  75.9  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  24.71 
 
 
823 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  25.5 
 
 
388 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0061  hypothetical protein  24.29 
 
 
415 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.33 
 
 
383 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3584  hypothetical protein  24.55 
 
 
583 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.632937 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3583  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.06 
 
 
389 aa  50.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.436734 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  20.83 
 
 
419 aa  43.1  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>