46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2629 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  100 
 
 		 397 aa  818    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  56.4 
 
 		 388 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1703  Exo-alpha-sialidase  41.62 
 
 		 391 aa  260  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.137706  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  38.8 
 
 		 559 aa  235  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2856  Neuraminidase (sialidase)-like protein  33.76 
 
 		 425 aa  178  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.832165  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1440  Exo-alpha-sialidase  36.3 
 
 		 391 aa  176  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0016  Exo-alpha-sialidase  29.61 
 
 		 515 aa  159  6e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5835  Exo-alpha-sialidase  33.06 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1436  neuramidase  32.13 
 
 		 367 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.816222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  30.33 
 
 		 399 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  34.04 
 
 		 419 aa  154  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  30.97 
 
 		 978 aa  152  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  32.39 
 
 		 1015 aa  145  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2227  hypothetical protein  29.41 
 
 		 421 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1515  exo-alpha-sialidase  30.45 
 
 		 949 aa  143  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0352  sialidase, putative  31.94 
 
 		 526 aa  140  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0283127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2214  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  31.28 
 
 		 549 aa  140  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3385  Exo-alpha-sialidase  31.27 
 
 		 558 aa  129  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0189  exo-alpha-sialidase  30.13 
 
 		 589 aa  126  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1835  Exo-alpha-sialidase  27.53 
 
 		 674 aa  126  8.000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3253  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 523 aa  123  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  normal  0.018694 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08300  BNR/Asp-box repeat protein  29.97 
 
 		 408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195911  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0721  putative exo-alpha-sialidase  26.34 
 
 		 694 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08290  hypothetical protein  28.21 
 
 		 377 aa  99.4  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0551571  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0471  BNR domain-containing protein  25.97 
 
 		 543 aa  89.4  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  28.93 
 
 		 1173 aa  86.7  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2712  hypothetical protein  24.7 
 
 		 509 aa  81.3  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2216  hypothetical protein  27.44 
 
 		 652 aa  80.1  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1914  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 472 aa  72.4  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1932  neuraminidase-related protein  24.29 
 
 		 816 aa  70.5  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00773567  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1808  BNR/Asp-box repeat domain protein  24.68 
 
 		 348 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1381  neuraminidase  26.98 
 
 		 807 aa  57  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0985  sialidase  23.75 
 
 		 382 aa  53.1  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00120415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0877  sialidase  24.32 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0420038  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  24.34 
 
 		 823 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02900  conserved hypothetical protein  24.57 
 
 		 372 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1340  putative cytoplasmic protein  23.68 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3584  hypothetical protein  23.53 
 
 		 583 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.632937 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0623  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.66 
 
 		 436 aa  47  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.815723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1929  putative cytoplasmic protein  22.96 
 
 		 347 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.733619  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1371  hypothetical protein  22.96 
 
 		 347 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.182179 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1356  putative cytoplasmic protein  22.96 
 
 		 347 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0360732 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1324  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25 
 
 		 354 aa  44.3  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.12068  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4486  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 442 aa  43.5  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.159898  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2779  exported exo-alpha-sialidase  24.12 
 
 		 378 aa  43.5  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>