45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4268 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4268  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  750    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1808  BNR/Asp-box repeat domain protein  42.15 
 
 		 348 aa  267  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01621  BNR/Asp-box repeat domain protein  46.15 
 
 		 350 aa  265  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2148  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  45.25 
 
 		 361 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  43.93 
 
 		 1251 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2779  exported exo-alpha-sialidase  41.64 
 
 		 378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4078  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  40.06 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2045  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.75 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7180  putative neuraminidase  37.76 
 
 		 370 aa  219  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.832478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2863  hypothetical protein  36.15 
 
 		 371 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1340  putative cytoplasmic protein  35.8 
 
 		 347 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1371  hypothetical protein  35.8 
 
 		 347 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.182179 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1356  putative cytoplasmic protein  35.8 
 
 		 347 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0360732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1929  putative cytoplasmic protein  36.53 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.733619  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3918  hypothetical protein  35.14 
 
 		 350 aa  159  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02900  conserved hypothetical protein  27.45 
 
 		 372 aa  110  6e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5961  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.99 
 
 		 395 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6297  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.74 
 
 		 395 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.715127 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1532  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.74 
 
 		 395 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8131  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.53 
 
 		 398 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6956  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.48 
 
 		 395 aa  89.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1043  hypothetical protein  26.51 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6450  putative glycosyl hydrolase protein  25.9 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.645858  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1246  BNR/Asp-box repeat-containing protein  27.12 
 
 		 417 aa  82.8  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6273  putative glycosyl hydrolase protein  26.3 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1110  hypothetical protein  26.32 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3984  hypothetical protein  25.32 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3711  hypothetical protein  25.13 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3540  hypothetical protein  23.9 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.326221  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0644  hypothetical protein  25.72 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175694  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3075  BNR/Asp-box repeat-containing protein  25.06 
 
 		 461 aa  76.3  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0562  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270788  normal  0.469707 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0557  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.88 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.560584 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1110  BNR/Asp-box repeat protein  27.7 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1897  BNR/Asp-box repeat protein  27.18 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.417517  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3508  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.07 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  27.02 
 
 		 823 aa  64.7  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0687  hypothetical protein  23.71 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0061  hypothetical protein  24.01 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07930  conserved hypothetical protein  24.42 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1324  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.66 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.12068  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.4 
 
 		 383 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3583  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.1 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.436734 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3584  hypothetical protein  22.61 
 
 		 583 aa  47  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.632937 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  22.9 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>