52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6273 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6450  putative glycosyl hydrolase protein  90.38 
 
 
394 aa  743    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.645858  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6273  putative glycosyl hydrolase protein  100 
 
 
395 aa  813    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160576  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5961  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  55.37 
 
 
395 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8131  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  54.66 
 
 
398 aa  431  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3540  hypothetical protein  52.05 
 
 
395 aa  423  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.326221  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3711  hypothetical protein  51.79 
 
 
395 aa  419  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6956  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  53.99 
 
 
395 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1532  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  54.27 
 
 
395 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1043  hypothetical protein  53.96 
 
 
414 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6297  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  54.27 
 
 
395 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.715127 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0562  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  54.29 
 
 
391 aa  411  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270788  normal  0.469707 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1110  hypothetical protein  53.66 
 
 
413 aa  412  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0687  hypothetical protein  54.97 
 
 
393 aa  412  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0644  hypothetical protein  52.86 
 
 
391 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175694  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3984  hypothetical protein  50 
 
 
398 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07930  conserved hypothetical protein  45.73 
 
 
333 aa  296  5e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0061  hypothetical protein  35.05 
 
 
415 aa  192  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4078  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.34 
 
 
381 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  28.49 
 
 
1251 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2148  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.17 
 
 
361 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2779  exported exo-alpha-sialidase  27.98 
 
 
378 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1808  BNR/Asp-box repeat domain protein  27.82 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2863  hypothetical protein  28.3 
 
 
371 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3508  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.86 
 
 
432 aa  106  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01621  BNR/Asp-box repeat domain protein  27.81 
 
 
350 aa  104  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3918  hypothetical protein  25.27 
 
 
350 aa  102  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1929  putative cytoplasmic protein  26.8 
 
 
347 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.733619  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1356  putative cytoplasmic protein  26.8 
 
 
347 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0360732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1371  hypothetical protein  26.8 
 
 
347 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.182179 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3075  BNR/Asp-box repeat-containing protein  25.49 
 
 
461 aa  99.4  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7180  putative neuraminidase  27.82 
 
 
370 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.832478  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1340  putative cytoplasmic protein  26.8 
 
 
347 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1897  BNR/Asp-box repeat protein  27.08 
 
 
432 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.417517  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2045  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.26 
 
 
349 aa  96.7  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4268  hypothetical protein  26.3 
 
 
366 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168613  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1246  BNR/Asp-box repeat-containing protein  22.83 
 
 
417 aa  78.2  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1110  BNR/Asp-box repeat protein  22.8 
 
 
413 aa  75.9  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  21.27 
 
 
668 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02900  conserved hypothetical protein  24.87 
 
 
372 aa  62  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0557  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  20.97 
 
 
375 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.560584 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  26.17 
 
 
823 aa  50.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0062  hypothetical protein  33.33 
 
 
489 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.78779  decreased coverage  0.00675708 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5868  BNR/Asp-box repeat-containing protein  24.24 
 
 
481 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.636475 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1349  BNR/Asp-box repeat-containing protein  26.7 
 
 
479 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1008  BNR/Asp-box repeat-containing protein  26.7 
 
 
479 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1545  BNR/Asp-box repeat-containing protein  26.7 
 
 
458 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2736  BNR/Asp-box repeat-containing protein  26.7 
 
 
479 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2593  BNR/Asp-box repeat-containing protein  26.7 
 
 
479 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0204  BNR/Asp-box repeat-containing protein  26.7 
 
 
479 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148464  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0177  BNR/Asp-box repeat-containing protein  26.7 
 
 
428 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4437  BNR/Asp-box repeat-containing protein  23.81 
 
 
481 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3929  BNR/Asp-box repeat-containing protein  23.81 
 
 
481 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>