46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1356 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1356  putative cytoplasmic protein  100 
 
 		 347 aa  708    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0360732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1371  hypothetical protein  98.85 
 
 		 347 aa  702    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.182179 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1340  putative cytoplasmic protein  97.98 
 
 		 347 aa  694    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1929  putative cytoplasmic protein  98.85 
 
 		 347 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.733619  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3918  hypothetical protein  55.65 
 
 		 350 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2863  hypothetical protein  48.77 
 
 		 371 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02900  conserved hypothetical protein  34.1 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2148  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.69 
 
 		 361 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1808  BNR/Asp-box repeat domain protein  37.39 
 
 		 348 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  36.31 
 
 		 1251 aa  172  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4268  hypothetical protein  35.8 
 
 		 366 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7180  putative neuraminidase  34.73 
 
 		 370 aa  169  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.832478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2779  exported exo-alpha-sialidase  36.34 
 
 		 378 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2045  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.93 
 
 		 349 aa  159  9e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01621  BNR/Asp-box repeat domain protein  35.91 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4078  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.91 
 
 		 381 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5961  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.93 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6956  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.21 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0644  hypothetical protein  28.02 
 
 		 391 aa  110  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175694  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6297  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27 
 
 		 395 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.715127 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1532  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27 
 
 		 395 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3984  hypothetical protein  27.86 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6273  putative glycosyl hydrolase protein  26.8 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0687  hypothetical protein  27.11 
 
 		 393 aa  99  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6450  putative glycosyl hydrolase protein  26.36 
 
 		 394 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.645858  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0562  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 391 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270788  normal  0.469707 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3711  hypothetical protein  25.26 
 
 		 395 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8131  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.51 
 
 		 398 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3540  hypothetical protein  24.49 
 
 		 395 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.326221  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1110  hypothetical protein  26.63 
 
 		 413 aa  93.2  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1043  hypothetical protein  27.14 
 
 		 414 aa  93.2  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1110  BNR/Asp-box repeat protein  27.81 
 
 		 413 aa  90.9  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1246  BNR/Asp-box repeat-containing protein  27.7 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1897  BNR/Asp-box repeat protein  27.97 
 
 		 432 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.417517  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3508  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.43 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0061  hypothetical protein  25.33 
 
 		 415 aa  69.3  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3075  BNR/Asp-box repeat-containing protein  25.26 
 
 		 461 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  25.93 
 
 		 823 aa  66.6  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07930  conserved hypothetical protein  22.78 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0557  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.67 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.560584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2315  hypothetical protein  25.93 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0204417 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.96 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  22.93 
 
 		 388 aa  43.5  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4196  hypothetical protein  26.21 
 
 		 388 aa  43.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3584  hypothetical protein  24.83 
 
 		 583 aa  42.7  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.632937 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>