41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1110 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_1110  BNR/Asp-box repeat protein  100 
 
 
413 aa  845    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1246  BNR/Asp-box repeat-containing protein  68.42 
 
 
417 aa  589  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3075  BNR/Asp-box repeat-containing protein  37.29 
 
 
461 aa  244  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1897  BNR/Asp-box repeat protein  36.36 
 
 
432 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.417517  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3508  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.36 
 
 
432 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0557  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.09 
 
 
375 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.560584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7180  putative neuraminidase  30.86 
 
 
370 aa  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.832478  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2148  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.21 
 
 
361 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2045  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.9 
 
 
349 aa  103  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01621  BNR/Asp-box repeat domain protein  28.57 
 
 
350 aa  102  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3918  hypothetical protein  29.31 
 
 
350 aa  96.3  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1808  BNR/Asp-box repeat domain protein  27.78 
 
 
348 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1371  hypothetical protein  28.09 
 
 
347 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.182179 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1356  putative cytoplasmic protein  27.81 
 
 
347 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0360732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1929  putative cytoplasmic protein  27.81 
 
 
347 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.733619  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4078  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.65 
 
 
381 aa  90.1  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1340  putative cytoplasmic protein  27.81 
 
 
347 aa  90.1  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2863  hypothetical protein  27.64 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  27.64 
 
 
1251 aa  83.2  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1532  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.86 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6297  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.86 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.715127 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6956  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.86 
 
 
395 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2779  exported exo-alpha-sialidase  27.84 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6450  putative glycosyl hydrolase protein  23.69 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.645858  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6273  putative glycosyl hydrolase protein  22.8 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160576  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5961  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.32 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4268  hypothetical protein  27.7 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168613  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0644  hypothetical protein  22.99 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175694  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0687  hypothetical protein  22.55 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3540  hypothetical protein  22.75 
 
 
395 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.326221  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1110  hypothetical protein  25.88 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3711  hypothetical protein  22.75 
 
 
395 aa  67.4  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8131  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.72 
 
 
398 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0562  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.2 
 
 
391 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270788  normal  0.469707 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3984  hypothetical protein  21.61 
 
 
398 aa  63.2  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1043  hypothetical protein  24.61 
 
 
414 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02900  conserved hypothetical protein  25 
 
 
372 aa  57  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0061  hypothetical protein  20.28 
 
 
415 aa  49.3  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  23.1 
 
 
823 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07930  conserved hypothetical protein  21.55 
 
 
333 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.22 
 
 
383 aa  42.7  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>