39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3583 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3583  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 		 389 aa  792    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.436734 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1324  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  40 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.12068  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3584  hypothetical protein  25.81 
 
 		 583 aa  86.7  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.632937 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1808  BNR/Asp-box repeat domain protein  29.31 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1547  hypothetical protein  26.39 
 
 		 595 aa  62.8  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.180047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0562  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.77 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270788  normal  0.469707 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07930  conserved hypothetical protein  22.92 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0644  hypothetical protein  25 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175694  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2863  hypothetical protein  27.73 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3711  hypothetical protein  26.64 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01621  BNR/Asp-box repeat domain protein  24.45 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3540  hypothetical protein  24.32 
 
 		 395 aa  57  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.326221  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2779  exported exo-alpha-sialidase  25.35 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2214  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 549 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6297  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.18 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.715127 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1532  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.18 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  23.4 
 
 		 1251 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6956  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.56 
 
 		 395 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0687  hypothetical protein  25.35 
 
 		 393 aa  53.5  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0061  hypothetical protein  31.82 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  26.84 
 
 		 823 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1899  hypothetical protein  25.87 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.20123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4078  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.89 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5961  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.15 
 
 		 395 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7180  putative neuraminidase  24.06 
 
 		 370 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.832478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4268  hypothetical protein  23.1 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8131  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.49 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02900  conserved hypothetical protein  23.35 
 
 		 372 aa  47.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1900  hypothetical protein  24.58 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1043  hypothetical protein  23.32 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0557  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.33 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.560584 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0985  sialidase  25.85 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00120415  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1110  hypothetical protein  25.64 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3984  hypothetical protein  23.44 
 
 		 398 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.74 
 
 		 559 aa  43.9  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0877  sialidase  25.42 
 
 		 382 aa  43.5  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0420038  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2045  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.58 
 
 		 349 aa  43.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08300  BNR/Asp-box repeat protein  21.82 
 
 		 408 aa  43.1  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>