40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2045 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2045  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 
349 aa  712    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7180  putative neuraminidase  44.54 
 
 
370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.832478  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01621  BNR/Asp-box repeat domain protein  43.2 
 
 
350 aa  297  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1808  BNR/Asp-box repeat domain protein  41.36 
 
 
348 aa  257  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4078  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.98 
 
 
381 aa  253  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  41.69 
 
 
1251 aa  250  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2148  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  39.48 
 
 
361 aa  244  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2779  exported exo-alpha-sialidase  39.62 
 
 
378 aa  241  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4268  hypothetical protein  36.75 
 
 
366 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168613  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2863  hypothetical protein  33.99 
 
 
371 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3918  hypothetical protein  33.13 
 
 
350 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1371  hypothetical protein  33.93 
 
 
347 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.182179 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1356  putative cytoplasmic protein  33.93 
 
 
347 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0360732 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1340  putative cytoplasmic protein  33.83 
 
 
347 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1929  putative cytoplasmic protein  33.93 
 
 
347 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.733619  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1110  BNR/Asp-box repeat protein  25.9 
 
 
413 aa  103  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6273  putative glycosyl hydrolase protein  26.26 
 
 
395 aa  96.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160576  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02900  conserved hypothetical protein  26.9 
 
 
372 aa  95.1  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1246  BNR/Asp-box repeat-containing protein  27.05 
 
 
417 aa  94.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8131  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.61 
 
 
398 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6956  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.86 
 
 
395 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1532  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.14 
 
 
395 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1110  hypothetical protein  25.84 
 
 
413 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6297  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.14 
 
 
395 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.715127 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5961  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.86 
 
 
395 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6450  putative glycosyl hydrolase protein  25.21 
 
 
394 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.645858  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3984  hypothetical protein  25 
 
 
398 aa  85.9  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3075  BNR/Asp-box repeat-containing protein  26.02 
 
 
461 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0562  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.02 
 
 
391 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270788  normal  0.469707 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0644  hypothetical protein  26.04 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175694  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1043  hypothetical protein  25.19 
 
 
414 aa  77  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1897  BNR/Asp-box repeat protein  23.78 
 
 
432 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.417517  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0687  hypothetical protein  25.56 
 
 
393 aa  75.9  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3508  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.31 
 
 
432 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3711  hypothetical protein  24.59 
 
 
395 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3540  hypothetical protein  24.19 
 
 
395 aa  70.5  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.326221  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0557  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.41 
 
 
375 aa  66.2  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.560584 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0061  hypothetical protein  19.57 
 
 
415 aa  52.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07930  conserved hypothetical protein  24.55 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3583  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.58 
 
 
389 aa  43.1  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.436734 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>