59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3780 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  100 
 
 		 823 aa  1694    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1581  BNR domain-containing protein  31.48 
 
 		 663 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3852  hypothetical protein  29.86 
 
 		 518 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00851115  normal  0.601351 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3584  hypothetical protein  27.41 
 
 		 583 aa  79.7  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.632937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  26.71 
 
 		 1251 aa  78.2  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2863  hypothetical protein  25.28 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8131  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.5 
 
 		 398 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3540  hypothetical protein  27.05 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.326221  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3711  hypothetical protein  25 
 
 		 395 aa  67.4  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1808  BNR/Asp-box repeat domain protein  25.97 
 
 		 348 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  25.24 
 
 		 978 aa  65.5  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1371  hypothetical protein  25.93 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.182179 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1929  putative cytoplasmic protein  25.93 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.733619  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1356  putative cytoplasmic protein  25.81 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0360732 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4268  hypothetical protein  27.02 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1340  putative cytoplasmic protein  26.32 
 
 		 347 aa  62.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0644  hypothetical protein  25.36 
 
 		 391 aa  62  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175694  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1043  hypothetical protein  25.89 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2148  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.16 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3984  hypothetical protein  27.41 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2779  exported exo-alpha-sialidase  25.68 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7180  putative neuraminidase  24.71 
 
 		 370 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.832478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1900  hypothetical protein  34.84 
 
 		 384 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4078  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.48 
 
 		 381 aa  60.1  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6956  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.77 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6297  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.77 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.715127 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1532  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.77 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1110  hypothetical protein  25.25 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0562  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270788  normal  0.469707 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0687  hypothetical protein  23.7 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.94 
 
 		 383 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3918  hypothetical protein  25.71 
 
 		 350 aa  56.6  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  25.16 
 
 		 1015 aa  55.8  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0557  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.31 
 
 		 375 aa  56.2  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.560584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  24.34 
 
 		 388 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5961  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.32 
 
 		 395 aa  55.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.28 
 
 		 397 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1324  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.17 
 
 		 354 aa  54.3  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.12068  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  24.46 
 
 		 399 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3583  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.84 
 
 		 389 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.436734 
 
 
-
 
NC_002950  PG0352  sialidase, putative  27.92 
 
 		 526 aa  52.8  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0283127 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1835  Exo-alpha-sialidase  24.4 
 
 		 674 aa  52.4  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01621  BNR/Asp-box repeat domain protein  26.51 
 
 		 350 aa  52.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6450  putative glycosyl hydrolase protein  26.17 
 
 		 394 aa  51.6  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.645858  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02900  conserved hypothetical protein  24.64 
 
 		 372 aa  51.2  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1547  hypothetical protein  29.63 
 
 		 595 aa  50.8  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.180047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6273  putative glycosyl hydrolase protein  26.17 
 
 		 395 aa  50.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1110  BNR/Asp-box repeat protein  23.1 
 
 		 413 aa  48.9  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  21.05 
 
 		 419 aa  47.8  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 559 aa  47.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2856  Neuraminidase (sialidase)-like protein  28.47 
 
 		 425 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.832165  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1932  neuraminidase-related protein  26.7 
 
 		 816 aa  47.8  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00773567  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08290  hypothetical protein  29.6 
 
 		 377 aa  47.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0551571  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2214  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.55 
 
 		 549 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3253  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  21.89 
 
 		 523 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  normal  0.018694 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2227  hypothetical protein  25.31 
 
 		 421 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08300  BNR/Asp-box repeat protein  28.68 
 
 		 408 aa  46.2  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195911  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07930  conserved hypothetical protein  24.75 
 
 		 333 aa  45.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0016  Exo-alpha-sialidase  22.58 
 
 		 515 aa  44.7  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>