50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0687 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3711  hypothetical protein  83.5 
 
 		 395 aa  696    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3540  hypothetical protein  82.74 
 
 		 395 aa  690    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.326221  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0644  hypothetical protein  86.51 
 
 		 391 aa  696    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175694  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0687  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  819    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8131  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  66.93 
 
 		 398 aa  535  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5961  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  64.71 
 
 		 395 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6956  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  63.27 
 
 		 395 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1532  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  63.43 
 
 		 395 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6297  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  63.43 
 
 		 395 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.715127 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0562  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  66.14 
 
 		 391 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270788  normal  0.469707 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1043  hypothetical protein  60.35 
 
 		 414 aa  478  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1110  hypothetical protein  59.01 
 
 		 413 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6273  putative glycosyl hydrolase protein  56.08 
 
 		 395 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6450  putative glycosyl hydrolase protein  53.12 
 
 		 394 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.645858  normal  0.142716 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07930  conserved hypothetical protein  53.17 
 
 		 333 aa  350  2e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3984  hypothetical protein  44.95 
 
 		 398 aa  332  6e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0061  hypothetical protein  34.78 
 
 		 415 aa  189  8e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4078  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.18 
 
 		 381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2779  exported exo-alpha-sialidase  30.03 
 
 		 378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  28.8 
 
 		 1251 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01621  BNR/Asp-box repeat domain protein  28.8 
 
 		 350 aa  110  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2148  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.49 
 
 		 361 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1808  BNR/Asp-box repeat domain protein  29.16 
 
 		 348 aa  109  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7180  putative neuraminidase  28.85 
 
 		 370 aa  99.4  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.832478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3918  hypothetical protein  27.13 
 
 		 350 aa  99  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3508  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.54 
 
 		 432 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1929  putative cytoplasmic protein  27.11 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.733619  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1371  hypothetical protein  27.11 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.182179 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1356  putative cytoplasmic protein  27.11 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0360732 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1340  putative cytoplasmic protein  26.09 
 
 		 347 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1897  BNR/Asp-box repeat protein  23.91 
 
 		 432 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.417517  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2863  hypothetical protein  25.41 
 
 		 371 aa  92.8  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02900  conserved hypothetical protein  25.69 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2045  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.83 
 
 		 349 aa  75.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3075  BNR/Asp-box repeat-containing protein  24.41 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1110  BNR/Asp-box repeat protein  22.55 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  22.55 
 
 		 668 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.02 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0557  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.57 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.560584 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1246  BNR/Asp-box repeat-containing protein  21.07 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4268  hypothetical protein  23.71 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1900  hypothetical protein  24.6 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  23.7 
 
 		 823 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3583  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.82 
 
 		 389 aa  53.5  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.436734 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  25.38 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2169  BNR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 459 aa  44.3  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.361013  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2497  hypothetical protein  35.23 
 
 		 432 aa  43.9  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0531892 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12450  hypothetical protein  26.5 
 
 		 933 aa  43.1  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.277877  normal  0.37002 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3584  hypothetical protein  26.92 
 
 		 583 aa  43.1  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.632937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1515  exo-alpha-sialidase  25.38 
 
 		 949 aa  43.1  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>