51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3447 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  100 
 
 		 559 aa  1144    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1703  Exo-alpha-sialidase  50 
 
 		 391 aa  362  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.137706  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  38.8 
 
 		 397 aa  235  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  38.9 
 
 		 388 aa  225  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2856  Neuraminidase (sialidase)-like protein  39.28 
 
 		 425 aa  216  7e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.832165  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1436  neuramidase  38.86 
 
 		 367 aa  205  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.816222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  37.71 
 
 		 399 aa  198  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0016  Exo-alpha-sialidase  33.33 
 
 		 515 aa  194  5e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5835  Exo-alpha-sialidase  35.11 
 
 		 392 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2227  hypothetical protein  36.44 
 
 		 421 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2214  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  31.57 
 
 		 549 aa  182  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  35.51 
 
 		 419 aa  182  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1515  exo-alpha-sialidase  33.24 
 
 		 949 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3253  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  35.03 
 
 		 523 aa  169  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  normal  0.018694 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1440  Exo-alpha-sialidase  35.89 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1835  Exo-alpha-sialidase  34.1 
 
 		 674 aa  164  5.0000000000000005e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0352  sialidase, putative  32.49 
 
 		 526 aa  160  8e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0283127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0189  exo-alpha-sialidase  34.15 
 
 		 589 aa  157  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  30.99 
 
 		 1015 aa  152  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  30.66 
 
 		 978 aa  152  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3385  Exo-alpha-sialidase  34.17 
 
 		 558 aa  151  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  36.76 
 
 		 1173 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2216  hypothetical protein  25.95 
 
 		 652 aa  137  7.000000000000001e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0721  putative exo-alpha-sialidase  34.34 
 
 		 694 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08300  BNR/Asp-box repeat protein  31.75 
 
 		 408 aa  130  7.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195911  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08290  hypothetical protein  31.12 
 
 		 377 aa  120  7.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0551571  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0985  sialidase  29.02 
 
 		 382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00120415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0877  sialidase  29.79 
 
 		 382 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0420038  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1914  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 472 aa  101  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0471  BNR domain-containing protein  25.79 
 
 		 543 aa  97.8  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2712  hypothetical protein  28.53 
 
 		 509 aa  95.5  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1932  neuraminidase-related protein  27.31 
 
 		 816 aa  85.9  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00773567  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1381  neuraminidase  30.16 
 
 		 807 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1900  hypothetical protein  25 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.92 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1324  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.76 
 
 		 354 aa  48.9  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.12068  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  23.44 
 
 		 823 aa  48.1  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1110  hypothetical protein  28.74 
 
 		 413 aa  47.8  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0623  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.815723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1899  hypothetical protein  25.19 
 
 		 399 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.20123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1545  BNR/Asp-box repeat-containing protein  31.4 
 
 		 458 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1349  BNR/Asp-box repeat-containing protein  31.4 
 
 		 479 aa  45.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0177  BNR/Asp-box repeat-containing protein  31.4 
 
 		 428 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1008  BNR/Asp-box repeat-containing protein  31.4 
 
 		 479 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0204  BNR/Asp-box repeat-containing protein  31.4 
 
 		 479 aa  45.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148464  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2593  BNR/Asp-box repeat-containing protein  31.4 
 
 		 479 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2736  BNR/Asp-box repeat-containing protein  31.4 
 
 		 479 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3583  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.74 
 
 		 389 aa  43.9  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.436734 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07930  conserved hypothetical protein  26.07 
 
 		 333 aa  43.5  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2863  hypothetical protein  24.2 
 
 		 371 aa  43.5  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  24.02 
 
 		 668 aa  43.5  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>