38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1515 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1515  exo-alpha-sialidase  100 
 
 
949 aa  1932    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1381  neuraminidase  38.87 
 
 
807 aa  219  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  33.24 
 
 
559 aa  173  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  30.45 
 
 
397 aa  143  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1703  Exo-alpha-sialidase  27.81 
 
 
391 aa  142  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.137706  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2856  Neuraminidase (sialidase)-like protein  29.56 
 
 
425 aa  135  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.832165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  32.69 
 
 
1015 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  29.74 
 
 
388 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  32.43 
 
 
978 aa  129  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0016  Exo-alpha-sialidase  26.54 
 
 
515 aa  126  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5835  Exo-alpha-sialidase  29.6 
 
 
392 aa  125  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0189  exo-alpha-sialidase  30.53 
 
 
589 aa  123  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2214  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.34 
 
 
549 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1835  Exo-alpha-sialidase  28.93 
 
 
674 aa  117  7.999999999999999e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3253  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.73 
 
 
523 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  normal  0.018694 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3385  Exo-alpha-sialidase  29.46 
 
 
558 aa  113  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  28.65 
 
 
399 aa  108  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08300  BNR/Asp-box repeat protein  30.66 
 
 
408 aa  106  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195911  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1440  Exo-alpha-sialidase  29.97 
 
 
391 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0352  sialidase, putative  26.8 
 
 
526 aa  100  9e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0283127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2227  hypothetical protein  27.37 
 
 
421 aa  95.1  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735505  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  26.58 
 
 
419 aa  92  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1436  neuramidase  25.68 
 
 
367 aa  85.1  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.816222  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1759  BNR/Asp-box repeat-containing protein  31.14 
 
 
571 aa  84  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00340531  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0721  putative exo-alpha-sialidase  28.52 
 
 
694 aa  80.1  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  28.02 
 
 
1173 aa  79.7  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0985  sialidase  27.42 
 
 
382 aa  79  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00120415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0877  sialidase  31.6 
 
 
382 aa  77  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0420038  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08290  hypothetical protein  28.95 
 
 
377 aa  74.3  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0551571  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1932  neuraminidase-related protein  27.34 
 
 
816 aa  74.3  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00773567  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2216  hypothetical protein  27.52 
 
 
652 aa  72.4  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0471  BNR domain-containing protein  27.37 
 
 
543 aa  71.2  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1914  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.5 
 
 
472 aa  67.4  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1900  hypothetical protein  24.73 
 
 
384 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398807  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2712  hypothetical protein  25.99 
 
 
509 aa  57.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  31.63 
 
 
1916 aa  46.2  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0644  hypothetical protein  24.77 
 
 
391 aa  45.8  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175694  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  37.5 
 
 
1101 aa  44.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>