45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3020 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  100 
 
 		 388 aa  803    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  56.4 
 
 		 397 aa  431  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1703  Exo-alpha-sialidase  39.67 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.137706  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  38.9 
 
 		 559 aa  225  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5835  Exo-alpha-sialidase  32.43 
 
 		 392 aa  155  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  30.95 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1440  Exo-alpha-sialidase  33.5 
 
 		 391 aa  146  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2227  hypothetical protein  32.76 
 
 		 421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  31.96 
 
 		 978 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1436  neuramidase  31.59 
 
 		 367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.816222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2856  Neuraminidase (sialidase)-like protein  29.87 
 
 		 425 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.832165  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1515  exo-alpha-sialidase  29.74 
 
 		 949 aa  133  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0016  Exo-alpha-sialidase  29.97 
 
 		 515 aa  130  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3253  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 523 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  normal  0.018694 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  30.79 
 
 		 1015 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0189  exo-alpha-sialidase  30.15 
 
 		 589 aa  122  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3385  Exo-alpha-sialidase  28.65 
 
 		 558 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2214  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 549 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  31.06 
 
 		 419 aa  120  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1835  Exo-alpha-sialidase  28.84 
 
 		 674 aa  118  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0352  sialidase, putative  27.75 
 
 		 526 aa  115  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0283127 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08300  BNR/Asp-box repeat protein  30.89 
 
 		 408 aa  106  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195911  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08290  hypothetical protein  26.42 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0551571  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2216  hypothetical protein  27.82 
 
 		 652 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0721  putative exo-alpha-sialidase  27.74 
 
 		 694 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1914  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  30.55 
 
 		 472 aa  75.5  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0985  sialidase  26.45 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00120415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0877  sialidase  25.69 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0420038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  25.63 
 
 		 1173 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2712  hypothetical protein  25.42 
 
 		 509 aa  65.5  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0471  BNR domain-containing protein  26.02 
 
 		 543 aa  63.2  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7180  putative neuraminidase  25 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.832478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3584  hypothetical protein  23.41 
 
 		 583 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.632937 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1381  neuraminidase  28.12 
 
 		 807 aa  51.6  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1932  neuraminidase-related protein  35.14 
 
 		 816 aa  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00773567  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.87 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  23.46 
 
 		 823 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2863  hypothetical protein  24.19 
 
 		 371 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02900  conserved hypothetical protein  25.26 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1929  putative cytoplasmic protein  22.93 
 
 		 347 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.733619  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1371  hypothetical protein  22.93 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.182179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1897  BNR/Asp-box repeat protein  24.04 
 
 		 432 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.417517  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1356  putative cytoplasmic protein  22.93 
 
 		 347 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0360732 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3508  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.17 
 
 		 432 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1340  putative cytoplasmic protein  23.2 
 
 		 347 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.153382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>