32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2227 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2227  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  875    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  36.44 
 
 		 559 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1703  Exo-alpha-sialidase  35.64 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.137706  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 397 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  32.76 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0016  Exo-alpha-sialidase  30.55 
 
 		 515 aa  124  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2214  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.11 
 
 		 549 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  27.73 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2856  Neuraminidase (sialidase)-like protein  28.35 
 
 		 425 aa  117  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.832165  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5835  Exo-alpha-sialidase  31.79 
 
 		 392 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  30.81 
 
 		 978 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  27.08 
 
 		 419 aa  110  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  30.08 
 
 		 1015 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3253  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 523 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  normal  0.018694 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1835  Exo-alpha-sialidase  28.95 
 
 		 674 aa  99.8  8e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1440  Exo-alpha-sialidase  31.5 
 
 		 391 aa  97.8  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1515  exo-alpha-sialidase  27.37 
 
 		 949 aa  95.1  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2712  hypothetical protein  26.96 
 
 		 509 aa  88.2  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3385  Exo-alpha-sialidase  28.88 
 
 		 558 aa  83.2  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0189  exo-alpha-sialidase  26.59 
 
 		 589 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1436  neuramidase  27.22 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.816222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0352  sialidase, putative  26.78 
 
 		 526 aa  73.6  0.000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0283127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2216  hypothetical protein  32.44 
 
 		 652 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08300  BNR/Asp-box repeat protein  27.36 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195911  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0877  sialidase  26.81 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0420038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0985  sialidase  29.53 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00120415  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1932  neuraminidase-related protein  38.54 
 
 		 816 aa  61.2  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00773567  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0721  putative exo-alpha-sialidase  25.87 
 
 		 694 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  29.82 
 
 		 1173 aa  58.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1914  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.33 
 
 		 472 aa  51.2  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0471  BNR domain-containing protein  25.66 
 
 		 543 aa  50.4  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  28.66 
 
 		 823 aa  43.1  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>