32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1932 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1932  neuraminidase-related protein  100 
 
 
816 aa  1692    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00773567  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0721  putative exo-alpha-sialidase  36.36 
 
 
694 aa  278  3e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  33.68 
 
 
1173 aa  231  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1703  Exo-alpha-sialidase  26.57 
 
 
391 aa  90.5  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.137706  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1835  Exo-alpha-sialidase  29.41 
 
 
674 aa  90.1  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.31 
 
 
559 aa  85.9  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3253  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.92 
 
 
523 aa  83.2  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  normal  0.018694 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  30.2 
 
 
1015 aa  80.9  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  28.23 
 
 
419 aa  80.1  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  29.31 
 
 
978 aa  77.4  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0016  Exo-alpha-sialidase  27.57 
 
 
515 aa  76.6  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1515  exo-alpha-sialidase  27.34 
 
 
949 aa  74.3  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  27.24 
 
 
399 aa  73.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.29 
 
 
397 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2214  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.06 
 
 
549 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0189  exo-alpha-sialidase  26.69 
 
 
589 aa  68.6  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08290  hypothetical protein  27.17 
 
 
377 aa  63.5  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0551571  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1436  neuramidase  24.8 
 
 
367 aa  62  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.816222  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2227  hypothetical protein  38.54 
 
 
421 aa  61.2  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735505  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5835  Exo-alpha-sialidase  34.31 
 
 
392 aa  60.8  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08300  BNR/Asp-box repeat protein  25.3 
 
 
408 aa  59.7  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195911  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2856  Neuraminidase (sialidase)-like protein  23.31 
 
 
425 aa  58.2  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.832165  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3385  Exo-alpha-sialidase  26.25 
 
 
558 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0352  sialidase, putative  27.06 
 
 
526 aa  52  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0283127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2216  hypothetical protein  27.62 
 
 
652 aa  52.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  35.14 
 
 
388 aa  52  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1440  Exo-alpha-sialidase  36.05 
 
 
391 aa  50.8  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1381  neuraminidase  26.01 
 
 
807 aa  50.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  27.36 
 
 
823 aa  47.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.08 
 
 
383 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1914  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.77 
 
 
472 aa  45.8  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0471  BNR domain-containing protein  43.64 
 
 
543 aa  45.1  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>