31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2216 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2216  hypothetical protein  100 
 
 		 652 aa  1341    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 559 aa  137  8e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1703  Exo-alpha-sialidase  26.81 
 
 		 391 aa  114  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.137706  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  29.92 
 
 		 419 aa  94.7  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1440  Exo-alpha-sialidase  26.42 
 
 		 391 aa  89  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0352  sialidase, putative  28.08 
 
 		 526 aa  84  0.000000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0283127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  27.82 
 
 		 388 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 397 aa  80.1  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3385  Exo-alpha-sialidase  27.78 
 
 		 558 aa  75.1  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0189  exo-alpha-sialidase  28.15 
 
 		 589 aa  73.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1515  exo-alpha-sialidase  27.52 
 
 		 949 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08300  BNR/Asp-box repeat protein  27.7 
 
 		 408 aa  72  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195911  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2227  hypothetical protein  32.44 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  26.82 
 
 		 399 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  27.69 
 
 		 978 aa  66.6  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1436  neuramidase  25.61 
 
 		 367 aa  63.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.816222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5835  Exo-alpha-sialidase  28.43 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08290  hypothetical protein  25.1 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0551571  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  29.07 
 
 		 1015 aa  57.4  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0877  sialidase  29.73 
 
 		 382 aa  57  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0420038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0985  sialidase  29.02 
 
 		 382 aa  56.6  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00120415  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  28.24 
 
 		 1173 aa  56.6  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0623  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 436 aa  54.7  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.815723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2214  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.09 
 
 		 549 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1932  neuraminidase-related protein  27.62 
 
 		 816 aa  52.4  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00773567  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2856  Neuraminidase (sialidase)-like protein  28.57 
 
 		 425 aa  51.2  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.832165  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1835  Exo-alpha-sialidase  25.71 
 
 		 674 aa  50.4  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3253  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 523 aa  48.5  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  normal  0.018694 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.25 
 
 		 383 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1914  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.51 
 
 		 472 aa  43.9  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0471  BNR domain-containing protein  24.62 
 
 		 543 aa  43.9  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>