34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0471 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0471  BNR domain-containing protein  100 
 
 		 543 aa  1122    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0352  sialidase, putative  31.15 
 
 		 526 aa  112  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0283127 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2856  Neuraminidase (sialidase)-like protein  26.54 
 
 		 425 aa  100  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.832165  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 559 aa  98.2  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0189  exo-alpha-sialidase  27.84 
 
 		 589 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1835  Exo-alpha-sialidase  29.92 
 
 		 674 aa  86.3  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0016  Exo-alpha-sialidase  26.22 
 
 		 515 aa  82.8  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08300  BNR/Asp-box repeat protein  30.51 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195911  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1914  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.16 
 
 		 472 aa  80.5  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1703  Exo-alpha-sialidase  26.72 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.137706  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2712  hypothetical protein  23.14 
 
 		 509 aa  76.6  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  26.15 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  28.13 
 
 		 978 aa  74.3  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3385  Exo-alpha-sialidase  26.46 
 
 		 558 aa  73.9  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  25.53 
 
 		 1015 aa  72.8  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1515  exo-alpha-sialidase  27.37 
 
 		 949 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3253  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 523 aa  71.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  normal  0.018694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5835  Exo-alpha-sialidase  26.49 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  26.02 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0721  putative exo-alpha-sialidase  41.18 
 
 		 694 aa  61.2  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0985  sialidase  26.71 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00120415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0877  sialidase  27.15 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0420038  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2214  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 549 aa  55.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  23.64 
 
 		 419 aa  52.4  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  26.37 
 
 		 1173 aa  52.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  33.33 
 
 		 1452 aa  52  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2227  hypothetical protein  25.66 
 
 		 421 aa  50.8  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00410  conserved repeat protein  35.4 
 
 		 1406 aa  49.3  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0351044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1436  neuramidase  23.64 
 
 		 367 aa  47.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.816222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0005  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.29 
 
 		 857 aa  45.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1932  neuraminidase-related protein  43.64 
 
 		 816 aa  45.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00773567  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2216  hypothetical protein  24.62 
 
 		 652 aa  43.9  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1440  Exo-alpha-sialidase  24.72 
 
 		 391 aa  43.5  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>