61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3577 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  100 
 
 
383 aa  793    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  31.79 
 
 
399 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3584  hypothetical protein  29.33 
 
 
583 aa  90.9  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.632937 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.23 
 
 
397 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2148  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.28 
 
 
361 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5835  Exo-alpha-sialidase  25.42 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3583  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.57 
 
 
389 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.436734 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2863  hypothetical protein  26.02 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2779  exported exo-alpha-sialidase  26.34 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  24.22 
 
 
1251 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07930  conserved hypothetical protein  25.75 
 
 
333 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0687  hypothetical protein  26.02 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1808  BNR/Asp-box repeat domain protein  27 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1324  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.05 
 
 
354 aa  65.5  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.12068  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0644  hypothetical protein  25.87 
 
 
391 aa  64.3  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175694  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1340  putative cytoplasmic protein  25.7 
 
 
347 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1835  Exo-alpha-sialidase  24.42 
 
 
674 aa  62.8  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4078  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.81 
 
 
381 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3711  hypothetical protein  25 
 
 
395 aa  59.7  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6297  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.53 
 
 
395 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.715127 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1532  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.53 
 
 
395 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2856  Neuraminidase (sialidase)-like protein  26.09 
 
 
425 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.832165  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.92 
 
 
559 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1900  hypothetical protein  24.73 
 
 
384 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398807  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0562  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.87 
 
 
391 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270788  normal  0.469707 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1929  putative cytoplasmic protein  25.31 
 
 
347 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.733619  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2214  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.33 
 
 
549 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1371  hypothetical protein  25.31 
 
 
347 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.182179 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8131  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.26 
 
 
398 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1356  putative cytoplasmic protein  25 
 
 
347 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0360732 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  25 
 
 
419 aa  57  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  25.94 
 
 
823 aa  56.6  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  24.43 
 
 
978 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4268  hypothetical protein  23.4 
 
 
366 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168613  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  27.91 
 
 
1015 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01621  BNR/Asp-box repeat domain protein  21.73 
 
 
350 aa  53.5  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1253  hypothetical protein  24.26 
 
 
437 aa  53.5  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.237005 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3253  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.21 
 
 
523 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  normal  0.018694 
 
 
-
 
NC_002950  PG0352  sialidase, putative  24.04 
 
 
526 aa  52.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0283127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7180  putative neuraminidase  23.33 
 
 
370 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.832478  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3918  hypothetical protein  31.3 
 
 
350 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0623  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.07 
 
 
436 aa  51.6  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.815723  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  22.87 
 
 
388 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0016  Exo-alpha-sialidase  26.52 
 
 
515 aa  51.2  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1703  Exo-alpha-sialidase  21.43 
 
 
391 aa  50.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.137706  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6956  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.08 
 
 
395 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1440  Exo-alpha-sialidase  24.76 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5961  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.58 
 
 
395 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1547  hypothetical protein  25 
 
 
595 aa  47.4  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.180047  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08290  hypothetical protein  24.15 
 
 
377 aa  47  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0551571  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3540  hypothetical protein  22.67 
 
 
395 aa  46.6  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.326221  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1932  neuraminidase-related protein  28.08 
 
 
816 aa  46.6  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00773567  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2216  hypothetical protein  25.25 
 
 
652 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0877  sialidase  25 
 
 
382 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0420038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0985  sialidase  25.42 
 
 
382 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00120415  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6450  putative glycosyl hydrolase protein  22.08 
 
 
394 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.645858  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1436  neuramidase  22.55 
 
 
367 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.816222  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1381  neuraminidase  31.51 
 
 
807 aa  45.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08300  BNR/Asp-box repeat protein  23.16 
 
 
408 aa  44.3  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195911  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  26.25 
 
 
1173 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1110  BNR/Asp-box repeat protein  24.22 
 
 
413 aa  42.7  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>