44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0543 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  71.78 
 
 		 978 aa  1430    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  100 
 
 		 1015 aa  2048    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08300  BNR/Asp-box repeat protein  46.4 
 
 		 408 aa  308  4.0000000000000004e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195911  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08290  hypothetical protein  41.18 
 
 		 377 aa  249  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0551571  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3385  Exo-alpha-sialidase  39.84 
 
 		 558 aa  199  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0189  exo-alpha-sialidase  37.19 
 
 		 589 aa  190  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 559 aa  153  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  31.86 
 
 		 397 aa  146  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2856  Neuraminidase (sialidase)-like protein  33.24 
 
 		 425 aa  143  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.832165  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1515  exo-alpha-sialidase  32.69 
 
 		 949 aa  132  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  29.64 
 
 		 419 aa  125  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
NC_002950  PG0352  sialidase, putative  30.77 
 
 		 526 aa  125  4e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0283127 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1835  Exo-alpha-sialidase  28.89 
 
 		 674 aa  125  4e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1703  Exo-alpha-sialidase  28.81 
 
 		 391 aa  124  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.137706  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  30.79 
 
 		 388 aa  124  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0016  Exo-alpha-sialidase  28.77 
 
 		 515 aa  123  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1914  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  31.6 
 
 		 472 aa  121  6e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  29.53 
 
 		 399 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2214  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 549 aa  112  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3253  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 523 aa  108  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  normal  0.018694 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2227  hypothetical protein  30.08 
 
 		 421 aa  107  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  27.34 
 
 		 1173 aa  100  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5835  Exo-alpha-sialidase  31.22 
 
 		 392 aa  99.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0721  putative exo-alpha-sialidase  26.85 
 
 		 694 aa  97.8  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1440  Exo-alpha-sialidase  29.28 
 
 		 391 aa  96.3  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1436  neuramidase  29.31 
 
 		 367 aa  92  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.816222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2712  hypothetical protein  27.94 
 
 		 509 aa  86.3  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1932  neuraminidase-related protein  30.98 
 
 		 816 aa  81.3  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00773567  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0471  BNR domain-containing protein  25.53 
 
 		 543 aa  72.4  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  27.54 
 
 		 4896 aa  63.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  28.49 
 
 		 1989 aa  63.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2216  hypothetical protein  29.07 
 
 		 652 aa  57.4  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1381  neuraminidase  27.92 
 
 		 807 aa  57.4  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  24.92 
 
 		 823 aa  57  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  24.86 
 
 		 8918 aa  56.6  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  28.93 
 
 		 3634 aa  54.7  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3667  parallel beta-helix repeat-containing transcriptional regulator AraC  28.85 
 
 		 2078 aa  54.7  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 383 aa  53.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3584  hypothetical protein  30.14 
 
 		 583 aa  51.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.632937 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0877  sialidase  23.95 
 
 		 382 aa  50.8  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0420038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0985  sialidase  22.49 
 
 		 382 aa  50.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00120415  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09240  conserved repeat protein  28.32 
 
 		 2912 aa  47.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  25.98 
 
 		 3486 aa  47  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  32.98 
 
 		 3191 aa  45.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>