31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1436 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1436  neuramidase  100 
 
 
367 aa  719    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.816222  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  38.86 
 
 
559 aa  205  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1703  Exo-alpha-sialidase  35.26 
 
 
391 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.137706  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5835  Exo-alpha-sialidase  35.93 
 
 
392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  32.13 
 
 
397 aa  155  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1440  Exo-alpha-sialidase  36.83 
 
 
391 aa  146  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  31.59 
 
 
388 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  29.28 
 
 
399 aa  106  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  29.21 
 
 
419 aa  104  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2856  Neuraminidase (sialidase)-like protein  27.47 
 
 
425 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.832165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  29.31 
 
 
1015 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1515  exo-alpha-sialidase  25.68 
 
 
949 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  29.54 
 
 
978 aa  83.6  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0352  sialidase, putative  27.01 
 
 
526 aa  80.9  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0283127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0189  exo-alpha-sialidase  27.1 
 
 
589 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3385  Exo-alpha-sialidase  29.54 
 
 
558 aa  76.3  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2227  hypothetical protein  27.22 
 
 
421 aa  73.6  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735505  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0016  Exo-alpha-sialidase  22.84 
 
 
515 aa  70.5  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2216  hypothetical protein  25.61 
 
 
652 aa  63.2  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1835  Exo-alpha-sialidase  25 
 
 
674 aa  62  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1932  neuraminidase-related protein  24.8 
 
 
816 aa  62  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00773567  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08300  BNR/Asp-box repeat protein  28.53 
 
 
408 aa  60.8  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195911  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2214  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  20.85 
 
 
549 aa  60.1  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2712  hypothetical protein  24.57 
 
 
509 aa  60.1  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08290  hypothetical protein  27.13 
 
 
377 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0551571  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0721  putative exo-alpha-sialidase  22.93 
 
 
694 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3253  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.58 
 
 
523 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  normal  0.018694 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0471  BNR domain-containing protein  23.64 
 
 
543 aa  47.4  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.55 
 
 
383 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1381  neuraminidase  28.38 
 
 
807 aa  43.1  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  23.27 
 
 
1173 aa  43.1  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>