22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1381 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1381  neuraminidase  100 
 
 		 807 aa  1654    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1515  exo-alpha-sialidase  38.87 
 
 		 949 aa  219  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 559 aa  82.4  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1703  Exo-alpha-sialidase  29.76 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.137706  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  30.93 
 
 		 978 aa  64.7  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  28.44 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0016  Exo-alpha-sialidase  26.64 
 
 		 515 aa  59.3  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  27.92 
 
 		 1015 aa  57.8  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 397 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0189  exo-alpha-sialidase  26.61 
 
 		 589 aa  54.7  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  25.3 
 
 		 419 aa  54.3  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2214  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.55 
 
 		 549 aa  52.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5835  Exo-alpha-sialidase  30.11 
 
 		 392 aa  52.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  27.23 
 
 		 388 aa  52  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1932  neuraminidase-related protein  26.01 
 
 		 816 aa  50.1  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00773567  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0352  sialidase, putative  24.41 
 
 		 526 aa  49.7  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0283127 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3385  Exo-alpha-sialidase  27.67 
 
 		 558 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0721  putative exo-alpha-sialidase  25.51 
 
 		 694 aa  48.1  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1440  Exo-alpha-sialidase  26.39 
 
 		 391 aa  47  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08300  BNR/Asp-box repeat protein  23.94 
 
 		 408 aa  47  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195911  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08290  hypothetical protein  26.03 
 
 		 377 aa  46.6  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0551571  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 383 aa  45.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>