39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2856 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2856  Neuraminidase (sialidase)-like protein  100 
 
 		 425 aa  872    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.832165  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0016  Exo-alpha-sialidase  44.29 
 
 		 515 aa  316  6e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3253  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  45.63 
 
 		 523 aa  290  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  normal  0.018694 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2214  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  39.49 
 
 		 549 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1835  Exo-alpha-sialidase  41.62 
 
 		 674 aa  244  1.9999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  39.28 
 
 		 559 aa  216  5e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  33.76 
 
 		 397 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1703  Exo-alpha-sialidase  32.38 
 
 		 391 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.137706  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  33.96 
 
 		 978 aa  150  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  32.17 
 
 		 399 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5835  Exo-alpha-sialidase  31.79 
 
 		 392 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0352  sialidase, putative  31.2 
 
 		 526 aa  144  4e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0283127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  33.24 
 
 		 1015 aa  143  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1515  exo-alpha-sialidase  29.56 
 
 		 949 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3385  Exo-alpha-sialidase  32.9 
 
 		 558 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  29.87 
 
 		 388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08300  BNR/Asp-box repeat protein  31.98 
 
 		 408 aa  133  6.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195911  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0189  exo-alpha-sialidase  32.21 
 
 		 589 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0721  putative exo-alpha-sialidase  26.35 
 
 		 694 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2227  hypothetical protein  28.35 
 
 		 421 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1440  Exo-alpha-sialidase  29.27 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08290  hypothetical protein  28.53 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0551571  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2712  hypothetical protein  28.38 
 
 		 509 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1436  neuramidase  27.47 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.816222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0471  BNR domain-containing protein  26.54 
 
 		 543 aa  100  6e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  26.91 
 
 		 1173 aa  96.7  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  26.58 
 
 		 419 aa  96.3  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0985  sialidase  26.98 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00120415  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1914  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.94 
 
 		 472 aa  75.9  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0877  sialidase  26.23 
 
 		 382 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0420038  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1932  neuraminidase-related protein  23.31 
 
 		 816 aa  58.2  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00773567  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1900  hypothetical protein  23.37 
 
 		 384 aa  53.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0005  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.5 
 
 		 857 aa  53.5  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2216  hypothetical protein  28.57 
 
 		 652 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1324  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.08 
 
 		 354 aa  51.6  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.12068  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  28.47 
 
 		 823 aa  47.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07930  conserved hypothetical protein  26.63 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4186  BNR/Asp-box repeat-containing protein  28.99 
 
 		 481 aa  43.9  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128008  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>