36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3584 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3584  hypothetical protein  100 
 
 		 583 aa  1205    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.632937 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1547  hypothetical protein  23.67 
 
 		 595 aa  105  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.180047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 383 aa  90.9  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3583  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.81 
 
 		 389 aa  86.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.436734 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1324  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.8 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.12068  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  27.41 
 
 		 823 aa  78.2  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  25.82 
 
 		 1251 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2148  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2863  hypothetical protein  22.89 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1808  BNR/Asp-box repeat domain protein  28.57 
 
 		 348 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  23.76 
 
 		 399 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2779  exported exo-alpha-sialidase  24.9 
 
 		 378 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01621  BNR/Asp-box repeat domain protein  24.81 
 
 		 350 aa  56.2  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8131  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.16 
 
 		 398 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0557  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.81 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.560584 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1110  hypothetical protein  21.48 
 
 		 413 aa  55.1  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07930  conserved hypothetical protein  27.2 
 
 		 333 aa  53.9  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0644  hypothetical protein  26.27 
 
 		 391 aa  53.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175694  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1043  hypothetical protein  22.82 
 
 		 414 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  23.22 
 
 		 978 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7180  putative neuraminidase  24.55 
 
 		 370 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.832478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  23.41 
 
 		 388 aa  51.6  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4078  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.03 
 
 		 381 aa  51.6  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3540  hypothetical protein  26.47 
 
 		 395 aa  51.6  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.326221  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  30.14 
 
 		 1015 aa  51.2  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3918  hypothetical protein  26.05 
 
 		 350 aa  50.4  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  24.68 
 
 		 1173 aa  48.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 397 aa  48.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3711  hypothetical protein  25.12 
 
 		 395 aa  47.8  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4268  hypothetical protein  22.61 
 
 		 366 aa  47  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5961  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.98 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1371  hypothetical protein  20.92 
 
 		 347 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.182179 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1253  hypothetical protein  32.54 
 
 		 437 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.237005 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1340  putative cytoplasmic protein  20.62 
 
 		 347 aa  43.9  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0562  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.45 
 
 		 391 aa  43.9  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270788  normal  0.469707 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0061  hypothetical protein  27.61 
 
 		 415 aa  43.9  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>