27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2736 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4329  BNR/Asp-box repeat-containing protein  78.79 
 
 
480 aa  752    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.113261  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5856  BNR/Asp-box repeat-containing protein  74.38 
 
 
477 aa  713    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248978  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0177  BNR/Asp-box repeat-containing protein  99.77 
 
 
428 aa  863    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1008  BNR/Asp-box repeat-containing protein  100 
 
 
479 aa  964    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3929  BNR/Asp-box repeat-containing protein  79.21 
 
 
481 aa  751    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5868  BNR/Asp-box repeat-containing protein  79.42 
 
 
481 aa  751    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.636475 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3869  BNR/Asp-box repeat-containing protein  78.38 
 
 
480 aa  746    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4437  BNR/Asp-box repeat-containing protein  79.21 
 
 
481 aa  751    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4186  BNR/Asp-box repeat-containing protein  79.63 
 
 
481 aa  756    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128008  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1349  BNR/Asp-box repeat-containing protein  100 
 
 
479 aa  964    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1545  BNR/Asp-box repeat-containing protein  100 
 
 
458 aa  924    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2736  BNR/Asp-box repeat-containing protein  100 
 
 
479 aa  964    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2593  BNR/Asp-box repeat-containing protein  100 
 
 
479 aa  964    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0204  BNR/Asp-box repeat-containing protein  100 
 
 
479 aa  964    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148464  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6979  hypothetical protein  29.18 
 
 
476 aa  86.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4524  hypothetical protein  26.1 
 
 
617 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.691049  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4137  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.03 
 
 
421 aa  50.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.56922  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4249  putative signal peptide protein  28.03 
 
 
421 aa  50.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0577112  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05315  putative signal peptide protein  31.9 
 
 
417 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.559524 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05231  BNR/Asp-box repeat domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G06430)  26.7 
 
 
367 aa  47  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  31.4 
 
 
559 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2169  BNR repeat-containing protein  25.32 
 
 
459 aa  45.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.361013  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0883  hypothetical protein  29.45 
 
 
419 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0724858  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2387  hypothetical protein  29.63 
 
 
419 aa  43.9  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6273  putative glycosyl hydrolase protein  26.7 
 
 
395 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160576  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0871  hypothetical protein  28.4 
 
 
419 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4091  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.61 
 
 
402 aa  43.5  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>