51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1110 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1110  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  842    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1043  hypothetical protein  92.93 
 
 
414 aa  787    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8131  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  61.74 
 
 
398 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3540  hypothetical protein  58.6 
 
 
395 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.326221  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0562  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  58.71 
 
 
391 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270788  normal  0.469707 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6956  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  61.7 
 
 
395 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6297  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  61.7 
 
 
395 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.715127 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3711  hypothetical protein  58.82 
 
 
395 aa  464  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1532  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  61.7 
 
 
395 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0687  hypothetical protein  58.27 
 
 
393 aa  456  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5961  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  59.84 
 
 
395 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0644  hypothetical protein  59.51 
 
 
391 aa  451  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175694  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6450  putative glycosyl hydrolase protein  54.73 
 
 
394 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.645858  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6273  putative glycosyl hydrolase protein  53.66 
 
 
395 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160576  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3984  hypothetical protein  47.59 
 
 
398 aa  331  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07930  conserved hypothetical protein  48.82 
 
 
333 aa  322  8e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0061  hypothetical protein  35.22 
 
 
415 aa  183  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  32.9 
 
 
1251 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2148  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.81 
 
 
361 aa  136  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1808  BNR/Asp-box repeat domain protein  30.57 
 
 
348 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01621  BNR/Asp-box repeat domain protein  30.26 
 
 
350 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4078  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.91 
 
 
381 aa  122  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2779  exported exo-alpha-sialidase  30.47 
 
 
378 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2863  hypothetical protein  28.49 
 
 
371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7180  putative neuraminidase  28.08 
 
 
370 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.832478  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3918  hypothetical protein  27.81 
 
 
350 aa  99.4  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1929  putative cytoplasmic protein  26.63 
 
 
347 aa  93.2  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.733619  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1371  hypothetical protein  26.63 
 
 
347 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.182179 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3508  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.52 
 
 
432 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1897  BNR/Asp-box repeat protein  23.91 
 
 
432 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.417517  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1356  putative cytoplasmic protein  26.63 
 
 
347 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0360732 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1340  putative cytoplasmic protein  26.77 
 
 
347 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2045  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.84 
 
 
349 aa  87.4  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4268  hypothetical protein  26.32 
 
 
366 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168613  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3075  BNR/Asp-box repeat-containing protein  24.63 
 
 
461 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02900  conserved hypothetical protein  28.46 
 
 
372 aa  72.4  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1246  BNR/Asp-box repeat-containing protein  22.36 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1110  BNR/Asp-box repeat protein  25.88 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  23.82 
 
 
668 aa  63.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0557  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.85 
 
 
375 aa  60.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.560584 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  26.52 
 
 
823 aa  56.6  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3584  hypothetical protein  21.48 
 
 
583 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.632937 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1900  hypothetical protein  25.7 
 
 
384 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398807  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2480  hypothetical protein  28.29 
 
 
364 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27990  putative sialidase  26.92 
 
 
438 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.126788  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.74 
 
 
559 aa  47.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  24.57 
 
 
399 aa  47.4  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3583  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.64 
 
 
389 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.436734 
 
 
-
 
NC_003296  RS05315  putative signal peptide protein  29.09 
 
 
417 aa  44.3  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.559524 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2315  hypothetical protein  26.52 
 
 
392 aa  43.1  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0204417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.23 
 
 
630 aa  43.1  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>