19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2315 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2315  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  812    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0204417 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4196  hypothetical protein  47.7 
 
 		 388 aa  341  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0519  hypothetical protein  33.59 
 
 		 614 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.479378  hitchhiker  0.0000880431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1806  hypothetical protein  33.07 
 
 		 613 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00471412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2784  hypothetical protein  29.2 
 
 		 615 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00400401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1340  putative cytoplasmic protein  26.54 
 
 		 347 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2779  exported exo-alpha-sialidase  27.37 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2863  hypothetical protein  24.57 
 
 		 371 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4086  hypothetical protein  30.47 
 
 		 620 aa  50.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.837204  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2148  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.53 
 
 		 361 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2134  hypothetical protein  28.91 
 
 		 610 aa  49.7  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.242732  normal  0.940758 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01621  BNR/Asp-box repeat domain protein  24.24 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1371  hypothetical protein  26.54 
 
 		 347 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.182179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  30.25 
 
 		 1251 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1929  putative cytoplasmic protein  25.93 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.733619  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1356  putative cytoplasmic protein  25.93 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0360732 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4078  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.67 
 
 		 381 aa  43.9  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1808  BNR/Asp-box repeat domain protein  27.89 
 
 		 348 aa  43.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1110  hypothetical protein  26.52 
 
 		 413 aa  43.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>