16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4196 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4196  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  795    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2315  hypothetical protein  47.7 
 
 		 392 aa  341  1e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0204417 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  26.03 
 
 		 1251 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1806  hypothetical protein  31.58 
 
 		 613 aa  57  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00471412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2784  hypothetical protein  29.41 
 
 		 615 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00400401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4078  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.29 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0519  hypothetical protein  33.08 
 
 		 614 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.479378  hitchhiker  0.0000880431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1808  BNR/Asp-box repeat domain protein  26.09 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2148  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.8 
 
 		 361 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2779  exported exo-alpha-sialidase  25.81 
 
 		 378 aa  50.4  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2134  hypothetical protein  30.77 
 
 		 610 aa  50.1  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.242732  normal  0.940758 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1340  putative cytoplasmic protein  26.9 
 
 		 347 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1371  hypothetical protein  26.9 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.182179 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4086  hypothetical protein  27.56 
 
 		 620 aa  43.5  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.837204  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1356  putative cytoplasmic protein  26.21 
 
 		 347 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0360732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1929  putative cytoplasmic protein  26.21 
 
 		 347 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.733619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>