120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1807 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  54.47 
 
 
916 aa  1080    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  51.26 
 
 
910 aa  978    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 
1251 aa  2604    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  37.92 
 
 
895 aa  620  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  35.92 
 
 
935 aa  588  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  36.57 
 
 
899 aa  585  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  36.1 
 
 
909 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  34.83 
 
 
894 aa  563  1.0000000000000001e-159  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  36.24 
 
 
918 aa  561  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  36.22 
 
 
876 aa  553  1e-156  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  35.46 
 
 
941 aa  549  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  34.16 
 
 
904 aa  531  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  35.66 
 
 
951 aa  530  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2148  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  70.71 
 
 
361 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  33.69 
 
 
916 aa  498  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  33 
 
 
1107 aa  482  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  31.15 
 
 
941 aa  478  1e-133  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  31.16 
 
 
926 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2779  exported exo-alpha-sialidase  64.08 
 
 
378 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  33.03 
 
 
860 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  33.14 
 
 
860 aa  457  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  33.14 
 
 
860 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  33.03 
 
 
860 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  31 
 
 
931 aa  452  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  34.08 
 
 
1084 aa  440  9.999999999999999e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  31.69 
 
 
923 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  30.47 
 
 
971 aa  426  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4078  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  55.59 
 
 
381 aa  411  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  29.27 
 
 
901 aa  412  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  30.81 
 
 
855 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  32.86 
 
 
1061 aa  402  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  32.96 
 
 
851 aa  402  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1808  BNR/Asp-box repeat domain protein  58.41 
 
 
348 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  30.61 
 
 
859 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  31.76 
 
 
868 aa  392  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  31.94 
 
 
774 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  31.29 
 
 
829 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  30.09 
 
 
872 aa  360  9e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  29.15 
 
 
905 aa  357  1e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  30.91 
 
 
832 aa  357  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  29.59 
 
 
844 aa  357  1e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  29.13 
 
 
1429 aa  353  8e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  28.98 
 
 
880 aa  347  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  30.83 
 
 
757 aa  345  2.9999999999999997e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  31.45 
 
 
763 aa  341  4e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  28.67 
 
 
1507 aa  339  1.9999999999999998e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  28.34 
 
 
873 aa  338  3.9999999999999995e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  27.8 
 
 
910 aa  325  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  29.7 
 
 
774 aa  308  6e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01621  BNR/Asp-box repeat domain protein  48.44 
 
 
350 aa  300  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  28.23 
 
 
858 aa  292  2e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  26.45 
 
 
914 aa  292  3e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7180  putative neuraminidase  44.11 
 
 
370 aa  281  6e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.832478  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  28.43 
 
 
773 aa  275  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  28.41 
 
 
776 aa  263  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4268  hypothetical protein  43.93 
 
 
366 aa  254  7e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168613  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  25.93 
 
 
910 aa  253  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2045  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  41.69 
 
 
349 aa  250  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  27.71 
 
 
761 aa  233  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  25.51 
 
 
776 aa  233  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2863  hypothetical protein  40.44 
 
 
371 aa  218  8e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  24.39 
 
 
882 aa  200  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1356  putative cytoplasmic protein  36.31 
 
 
347 aa  172  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0360732 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1340  putative cytoplasmic protein  35.49 
 
 
347 aa  172  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1371  hypothetical protein  36.31 
 
 
347 aa  171  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.182179 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1929  putative cytoplasmic protein  36.31 
 
 
347 aa  171  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.733619  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3918  hypothetical protein  36.87 
 
 
350 aa  167  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02900  conserved hypothetical protein  33.6 
 
 
372 aa  160  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1532  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.37 
 
 
395 aa  146  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1043  hypothetical protein  33.07 
 
 
414 aa  146  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6297  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.37 
 
 
395 aa  146  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.715127 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6956  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.64 
 
 
395 aa  146  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1110  hypothetical protein  32.9 
 
 
413 aa  141  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5961  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.49 
 
 
395 aa  140  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0562  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  30.27 
 
 
391 aa  138  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270788  normal  0.469707 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6450  putative glycosyl hydrolase protein  28.38 
 
 
394 aa  122  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.645858  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8131  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31 
 
 
398 aa  123  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3711  hypothetical protein  29.46 
 
 
395 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6273  putative glycosyl hydrolase protein  28.49 
 
 
395 aa  121  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160576  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  21.73 
 
 
1118 aa  119  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3540  hypothetical protein  28.92 
 
 
395 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.326221  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  22.4 
 
 
1188 aa  114  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0644  hypothetical protein  30.52 
 
 
391 aa  112  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175694  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0687  hypothetical protein  28.8 
 
 
393 aa  110  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3075  BNR/Asp-box repeat-containing protein  27.78 
 
 
461 aa  104  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  21.41 
 
 
1187 aa  95.9  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3984  hypothetical protein  25.81 
 
 
398 aa  90.9  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  22.43 
 
 
733 aa  85.1  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07930  conserved hypothetical protein  27.03 
 
 
333 aa  83.2  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1110  BNR/Asp-box repeat protein  27.64 
 
 
413 aa  83.2  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1246  BNR/Asp-box repeat-containing protein  25.53 
 
 
417 aa  81.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  26.06 
 
 
823 aa  76.6  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3584  hypothetical protein  25.82 
 
 
583 aa  75.5  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.632937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  23.03 
 
 
755 aa  75.5  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  21.64 
 
 
793 aa  74.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0557  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.47 
 
 
375 aa  73.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.560584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  21.5 
 
 
770 aa  73.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  25.18 
 
 
734 aa  72.4  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  21.61 
 
 
801 aa  71.6  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0061  hypothetical protein  26.29 
 
 
415 aa  70.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>