72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2708 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  40.99 
 
 		 904 aa  696    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  51.8 
 
 		 757 aa  696    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  50 
 
 		 851 aa  771    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  43.73 
 
 		 895 aa  638    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  53.33 
 
 		 844 aa  818    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  50.87 
 
 		 829 aa  773    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  48.15 
 
 		 941 aa  783    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  49.74 
 
 		 763 aa  708    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  50.86 
 
 		 880 aa  761    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  45.69 
 
 		 1429 aa  754    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  53.57 
 
 		 859 aa  798    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  43.11 
 
 		 909 aa  717    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  51.65 
 
 		 872 aa  790    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  50.64 
 
 		 935 aa  819    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 931 aa  1840    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  42.92 
 
 		 918 aa  706    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  54.23 
 
 		 855 aa  878    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  44.61 
 
 		 858 aa  657    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  45.43 
 
 		 905 aa  754    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  47.55 
 
 		 1507 aa  772    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  54.33 
 
 		 901 aa  858    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  44.27 
 
 		 941 aa  669    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  47.71 
 
 		 832 aa  729    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  44.2 
 
 		 899 aa  639    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  47.8 
 
 		 774 aa  625  1e-177  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  35.96 
 
 		 860 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  36.16 
 
 		 860 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  36.43 
 
 		 860 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  36.02 
 
 		 860 aa  602  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  35.25 
 
 		 951 aa  567  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  45.98 
 
 		 1061 aa  535  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  40.88 
 
 		 868 aa  518  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  40.5 
 
 		 971 aa  497  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  40.64 
 
 		 776 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  36.75 
 
 		 910 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  39.87 
 
 		 773 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  36.03 
 
 		 876 aa  486  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  34.32 
 
 		 894 aa  470  1.0000000000000001e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  32.22 
 
 		 910 aa  473  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  32.56 
 
 		 916 aa  466  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  31.32 
 
 		 1251 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  37.48 
 
 		 776 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  38.77 
 
 		 873 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  35.75 
 
 		 1084 aa  419  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  32.76 
 
 		 1107 aa  408  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  28.09 
 
 		 916 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  33.29 
 
 		 774 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  26.8 
 
 		 926 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  28.94 
 
 		 923 aa  376  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  31.91 
 
 		 761 aa  259  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  25.69 
 
 		 914 aa  220  1e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  23.38 
 
 		 882 aa  203  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  27.69 
 
 		 910 aa  168  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  26.36 
 
 		 1118 aa  115  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  23.97 
 
 		 1188 aa  99.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  24.4 
 
 		 955 aa  74.3  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  22.24 
 
 		 1187 aa  71.6  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  19.15 
 
 		 733 aa  64.7  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  21.36 
 
 		 793 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  22.75 
 
 		 770 aa  62.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  20.08 
 
 		 572 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  23.39 
 
 		 757 aa  58.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  23.45 
 
 		 801 aa  57.4  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  22.92 
 
 		 755 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  20.24 
 
 		 831 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  22.65 
 
 		 883 aa  52.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  25.18 
 
 		 856 aa  52  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  21.79 
 
 		 839 aa  51.6  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  22.22 
 
 		 936 aa  46.6  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  22.73 
 
 		 819 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  28.44 
 
 		 826 aa  46.2  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  21.67 
 
 		 734 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>