93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2737 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  56.63 
 
 		 728 aa  889    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 734 aa  1541    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  64.63 
 
 		 734 aa  978    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  26.31 
 
 		 955 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  27.88 
 
 		 572 aa  176  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0959  alpha-L-rhamnosidase  26.53 
 
 		 585 aa  158  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.8736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  24.49 
 
 		 949 aa  151  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  23.69 
 
 		 801 aa  143  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  25.52 
 
 		 793 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  25.58 
 
 		 831 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  23.03 
 
 		 826 aa  129  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  27.32 
 
 		 1187 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  23.8 
 
 		 796 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  23.19 
 
 		 936 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  27.83 
 
 		 831 aa  118  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  23.57 
 
 		 819 aa  114  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  22 
 
 		 775 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  23.58 
 
 		 787 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  25.56 
 
 		 883 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  25.81 
 
 		 856 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  24.67 
 
 		 897 aa  104  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3982  alpha-L-rhamnosidase  22.45 
 
 		 553 aa  103  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0704694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  25.13 
 
 		 757 aa  102  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  24.08 
 
 		 733 aa  97.8  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2336  alpha-L-rhamnosidase  21.06 
 
 		 796 aa  97.8  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  22.51 
 
 		 839 aa  97.4  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  21.8 
 
 		 755 aa  90.9  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10867  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  23.83 
 
 		 805 aa  87.8  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  22.77 
 
 		 793 aa  87.8  6e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  25.07 
 
 		 770 aa  87.8  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  21.75 
 
 		 910 aa  84.3  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  24.03 
 
 		 844 aa  80.5  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  24.12 
 
 		 895 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10277  Alpha-rhamnosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU8]  20.97 
 
 		 661 aa  79  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  22.54 
 
 		 776 aa  78.6  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  20.88 
 
 		 1188 aa  77.4  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  21.28 
 
 		 910 aa  75.5  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  21.53 
 
 		 757 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  25.18 
 
 		 1251 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  23.85 
 
 		 763 aa  71.2  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02631  alpha-L-rhamnosidase C, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02880)  24.5 
 
 		 568 aa  70.1  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361171  normal  0.741957 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  24.01 
 
 		 774 aa  69.7  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03780  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  22.56 
 
 		 836 aa  68.9  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00577514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  21.98 
 
 		 951 aa  67.8  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  22.37 
 
 		 899 aa  67.4  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  20.51 
 
 		 1084 aa  66.6  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  22.19 
 
 		 904 aa  65.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  20.73 
 
 		 1118 aa  64.7  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  22.65 
 
 		 832 aa  64.7  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  21.25 
 
 		 926 aa  63.9  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  22 
 
 		 910 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  25.89 
 
 		 1061 aa  61.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  19.75 
 
 		 901 aa  60.8  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  23.58 
 
 		 855 aa  60.1  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  24.09 
 
 		 880 aa  60.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  21.52 
 
 		 876 aa  60.1  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06929  conserved hypothetical protein  45.28 
 
 		 556 aa  60.1  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.587599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  21.55 
 
 		 909 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  22.2 
 
 		 829 aa  58.9  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  22.01 
 
 		 1107 aa  58.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  22.52 
 
 		 941 aa  57.8  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  21.05 
 
 		 872 aa  57.4  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2118  Glycogen debranching protein-like protein  25 
 
 		 810 aa  55.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  20 
 
 		 894 aa  55.1  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  21.39 
 
 		 941 aa  53.9  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  21.86 
 
 		 774 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  21.81 
 
 		 873 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  23.48 
 
 		 916 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  21.58 
 
 		 1507 aa  52.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  22.1 
 
 		 773 aa  52.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4880  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.5 
 
 		 740 aa  52  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220077  hitchhiker  0.0000000000344612 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  21.18 
 
 		 1429 aa  51.6  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0759  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.8 
 
 		 740 aa  50.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043283  decreased coverage  0.0000165021 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4363  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25 
 
 		 741 aa  50.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718041  hitchhiker  0.000723282 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  22.11 
 
 		 776 aa  50.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  29.41 
 
 		 868 aa  48.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  22.03 
 
 		 923 aa  47.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  20.98 
 
 		 905 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4932  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.14 
 
 		 740 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0018634  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5355  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.8 
 
 		 740 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000277082  decreased coverage  0.00794917 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3435  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.14 
 
 		 740 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000283292  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.53 
 
 		 781 aa  46.6  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  21.06 
 
 		 916 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  26.87 
 
 		 675 aa  45.4  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.87 
 
 		 776 aa  45.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  24.12 
 
 		 651 aa  45.4  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.87 
 
 		 776 aa  45.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0445  hypothetical protein  26.83 
 
 		 593 aa  44.7  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  27.03 
 
 		 790 aa  44.7  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  21.64 
 
 		 931 aa  44.3  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.12 
 
 		 797 aa  44.3  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  26.12 
 
 		 770 aa  43.9  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0945  amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.12 
 
 		 770 aa  43.9  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00012577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>